如何更改numpy数组dtype和重塑?

时间:2016-06-28 18:26:45

标签: python arrays numpy

我有一个我从HDF5文件中读取的数组,它是一元组的一维数组。它的类型是:

[('cycle', '<u2'), ('dxn', 'i1'), ('i (mA)', '<f4'), ('V', '<f4'), ('R(Ohm)', '<f4')] 

我想将它从n x 1数组转换为np.float类型的(n / 5)x 5数组。

我尝试了np.astype,但这不起作用 - 它只返回n个元素。有什么简单的方法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

dtypes的混合使得这种转换比平时更加​​棘手。最后的答案是,将字段复制到目标数组具有速度和通用性的组合。

Convert structured array to regular NumPy array - 被建议为重复,但该案例包含所有浮点字段。

让我们构建一个样本:

In [850]: dt
Out[850]: dtype([('cycle', '<u2'), ('dxn', 'i1'), ('i (mA)', '<f4'), ('V', '<f4'), ('R(Ohm)', '<f4')])

In [851]: x=np.zeros((3,),dt)
In [852]: x['cycle']=[0,10,23]
In [853]: x['dxn']=[3,2,2]
In [854]: x['V']=[1,1,1]

In [855]: x
Out[855]: 
array([(0, 3, 0.0, 1.0, 0.0), (10, 2, 0.0, 1.0, 0.0),
       (23, 2, 0.0, 1.0, 0.0)], 
      dtype=[('cycle', '<u2'), ('dxn', 'i1'), ('i (mA)', '<f4'), ('V', '<f4'), ('R(Ohm)', '<f4')])

我们可以按照该链接中建议的方式查看3个浮点字段:

In [856]: dt1=np.dtype([('f0','float32',(3))])

In [857]: y=x[list(x.dtype.names[2:])].view(dt1)
# or x[list(x.dtype.names[2:])].view((np.float32, 3))

In [858]: y
Out[858]: 
array([([0.0, 1.0, 0.0],), ([0.0, 1.0, 0.0],), ([0.0, 1.0, 0.0],)], 
      dtype=[('f0', '<f4', (3,))])

In [859]: y['f0']
Out[859]: 
array([[ 0.,  1.,  0.],
       [ 0.,  1.,  0.],
       [ 0.,  1.,  0.]], dtype=float32)

但如果我想更改所有值,我需要制作y副本。不允许一次写入多个字段。

In [863]: y=x[list(x.dtype.names[2:])].view(dt1).copy()
In [864]: y['f0']=np.arange(9.).reshape(3,3)
带有一个dtype的

view不捕获行结构;我们必须用reshape添加回来。具有dt1形状的(3,)可以解决该问题。

In [867]: x[list(x.dtype.names[2:])].view(np.float32)
Out[867]: array([ 0.,  1.,  0.,  0.,  1.,  0.,  0.,  1.,  0.], dtype=float32)

https://stackoverflow.com/a/5957455/901925建议浏览一个列表。

In [868]: x.tolist()
Out[868]: [(0, 3, 0.0, 1.0, 0.0), (10, 2, 0.0, 1.0, 0.0), (23, 2, 0.0, 1.0, 0.0)]

In [869]: np.array(x.tolist())
Out[869]: 
array([[  0.,   3.,   0.,   1.,   0.],
       [ 10.,   2.,   0.,   1.,   0.],
       [ 23.,   2.,   0.,   1.,   0.]])

可以使用astype转换单个字段:

In [878]: x['cycle'].astype(np.float32)
Out[878]: array([  0.,  10.,  23.], dtype=float32)

In [879]: x['dxn'].astype(np.float32)
Out[879]: array([ 3.,  2.,  2.], dtype=float32)

但不是多个字段:

In [880]: x.astype(np.float32)
Out[880]: array([  0.,  10.,  23.], dtype=float32)

recfunctions帮助操纵结构化数组(并重新排列)

from numpy.lib import recfunctions

其中许多构造了一个新的空结构,并按字段复制值。在这种情况下的等价物:

In [890]: z=np.zeros((3,5),np.float32)    
In [891]: for i in range(5):
   .....:     z[:,i] = x[x.dtype.names[i]]

In [892]: z
Out[892]: 
array([[  0.,   3.,   0.,   1.,   0.],
       [ 10.,   2.,   0.,   1.,   0.],
       [ 23.,   2.,   0.,   1.,   0.]], dtype=float32)

在这个小案例中,它比np.array(x.tolist())慢一点。但对于30000条记录来说,这要快得多。

通常,结构化数组中的字段比字段多得多,因此对字段的迭代速度并不慢。