如何比较头文件（fasta）的一部分并将其与一个文件放在一起？

Question

我在目录中有更多fasta个文件，这些文件具有相同的开头但结尾不同：

file1abgff
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file2adferr
------------

file3adfr
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file1adcef
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如何在目录中比较所有文件的开头并将匹配项放在一个新文件（example >file1abgffadcef）？

Answer 1

此代码似乎可以解决您的问题。

假设您有输入文件：

cat input
>file1abgff
>file2adferr
>file3adfr
>file1adcef

这是我的解决方案：

 sed 's/[0-9]/& /' input | awk  '{a[$1]=($1 in a ? a[$1]"|"$2 : $0)}END{for (i in a){print a[i]}}' | sed 's/ //' | grep  "|" | sed 's/|//'

>file1abgffadcef