使用vis.js可视化networkx

Question

我正在使用Python库networkx创建一个包含近2k个节点的有向图，我希望使用vis.js库可视化图形

我知道如何将其导出为Json，但我无法生成兼容的格式直接将其用于vis.js

我应该有一个json String输出，如下所示：

节点：

[
  {id: 1, label: 'a'},
  {id: 2, label: 'b'},
  {id: 3, label: 'c'}
]

边缘：

[
    {from: 1, to: 2, label: 'label1'},
    {from: 1, to: 3, label: 'label2'},
    {from: 2, to: 4, label: 'label3'},
    {from: 2, to: 5, label: 'label3'}
]

Answer 1

我对viz.js不熟悉，但如果不是硬性要求，我建议您将图表导出到GEXF：

G = nx.path_graph(4)  # your graph here
nx.write_gexf(G, "test.gexf")

然后使用Sigma.js将其导入the dedicated GEXF importer plugin，这是一个专用的高性能图形库。

Answer 2

Jupyter的{​​{1}}端口。你可以找到它here。

该软件包位于visJS，但已开始移植到Python 2。

请注意，如上所述，它仅适用于Python 3（如果您问我，这很棒！）。