tl; dr 无法让ggpairs
中的独立图例(描述整个图表中的常见颜色)令我满意。
抱歉长度。
我正在尝试使用GGally::ggpairs
(一个用ggplot2
绘制各种绘图矩阵的扩展包)绘制(下三角)对图。这与How to add an external legend to ggpairs()?基本上是同一个问题,但我对这个问题的答案不满意,所以我将其作为一个扩展名发布(如果评论者建议/推荐,我会删除这个问题,代替那个问题提供赏金)。特别是,我希望图例在子图框外显示外,或者将其放在一个虚拟子图中,但允许额外的宽度来保持它,或者(理想情况下)将它放在一个单独的图中(空)子图。如下所示,我的部分解决方案都有问题。
虚假数据:
set.seed(101)
dd <- data.frame(x=rnorm(100),
y=rnorm(100),
z=rnorm(100),
f=sample(c("a","b"),size=100,replace=TRUE))
library(GGally)
基本情节功能:
ggfun <- function(...) {
ggpairs(dd,mapping = ggplot2::aes(color = f),
columns=1:3,
lower=list(continuous="points"),
diag=list(continuous="blankDiag"),
upper=list(continuous="blank"),
...)
}
修剪顶部/右侧列的功能:
trim_gg <- function(gg) {
n <- gg$nrow
gg$nrow <- gg$ncol <- n-1
v <- 1:n^2
gg$plots <- gg$plots[v>n & v%%n!=0]
gg$xAxisLabels <- gg$xAxisLabels[-n]
gg$yAxisLabels <- gg$yAxisLabels[-1]
return(gg)
}
gg0 <- trim_gg(ggfun(legends=TRUE))
删除左列中的图例(如上面的链接问题所示):
library(ggplot2) ## for theme()
for (i in 1:2) {
inner <- getPlot(gg0,i,1)
inner <- inner + theme(legend.position="none")
gg0 <- putPlot(gg0,inner,i,1)
}
inner <- getPlot(gg0,2,2)
inner <- inner + theme(legend.position="right")
gg0 <- putPlot(gg0,inner,2,2)
问题:
ggpairs
正在做的事情ggmatrix
/ ggpairs
看起来非常不灵活。我能够尝试远的唯一选择是通过提取图例并使用gridExtra::grid.arrange()
跟踪ggplot separate legend and plot:
g_legend <- function(a.gplot){
tmp <- ggplot_gtable(ggplot_build(a.gplot))
leg <- which(sapply(tmp$grobs, function(x) x$name) == "guide-box")
legend <- tmp$grobs[[leg]]
return(legend)
}
library(gridExtra)
grid.arrange(getPlot(gg0,1,1),
g_legend(getPlot(gg0,2,2)),
getPlot(gg0,2,1),
getPlot(gg0,2,2)+theme(legend.position="none"),
nrow=2)
问题:
ggpairs
压制的轴和标签又回来了...... 我还考虑过创建一个带有特殊情节的面板,该面板仅包含图例(即尝试使用theme(SOMETHING=element.blank)
来抑制情节本身,但无法弄清楚如何去做。
作为最后的手段,我可以在适当的时候修剪轴,但这实际上是重新发明了ggpairs
首先做的事情......
答案 0 :(得分:2)
对解决方案1稍作修改:首先,绘制没有图例的图表矩阵(但仍然使用颜色映射)。其次,使用trim_gg
函数删除对角线空格。第三,对于左上角位置的情节,绘制其图例但将其置于右侧的空白区域。
data(state)
dd <- data.frame(state.x77,
State = state.name,
Abbrev = state.abb,
Region = state.region,
Division = state.division)
columns <- c(3, 5, 6, 7)
colour <- "Region"
library(GGally)
library(ggplot2) ## for theme()
# Base plot
ggfun <- function(data = NULL, columns = NULL, colour = NULL, legends = FALSE) {
ggpairs(data,
columns = columns,
mapping = ggplot2::aes_string(colour = colour),
lower = list(continuous = "points"),
diag = list(continuous = "blankDiag"),
upper = list(continuous = "blank"),
legends = legends)
}
# Remove the diagonal elements
trim_gg <- function(gg) {
n <- gg$nrow
gg$nrow <- gg$ncol <- n-1
v <- 1:n^2
gg$plots <- gg$plots[v > n & v%%n != 0]
gg$xAxisLabels <- gg$xAxisLabels[-n]
gg$yAxisLabels <- gg$yAxisLabels[-1]
return(gg)
}
# Get the plot
gg0 <- trim_gg(ggfun(dd, columns, colour))
# For plot in position (1,1), draw its legend in the empty panels to the right
inner <- getPlot(gg0, 1, 1)
inner <- inner +
theme(legend.position = c(1.01, 0.5),
legend.direction = "horizontal",
legend.justification = "left") +
guides(colour = guide_legend(title.position = "top"))
gg0 <- putPlot(gg0, inner, 1, 1)
gg0