用C ++读取DICOM并转换为OpenCV

Question

我想用C ++阅读DICOM图像并使用opencv来操作它们。

我设法使用DCMTK读取了一个dicom图像但是，我不确定如何将其转换为opencv Mat。

以下是我目前的情况：

DicomImage DCM_image("test.dcm");
cv::Mat image(int(DCM_image.getWidth()), int(DCM_image.getHeight()), CV_8U, (uchar*)DCM_image.getOutputData(8));

导致以下结果：

在DICOM查看器中，它看起来如下：

标准化后，灰色图像显示如下：

非常感谢任何帮助。

Answer 1

我现在能看到的主要问题是像素值范围（深度）的差异。

AFAIK，DICOM可以有一个相当大的深度（16位），而你正试图融入CV_8U，这只是8位。您可以使用DicomImage::getDepth()获取DicomImage实例的深度，然后创建一个具有适当深度的cv::Mat来保存您的图片数据。

您可能还需要规范化数据以最大限度地利用您的可用范围，以便cv::imshow()的显示看起来像预期的那样。

所以：

• 在您的DCM_image上执行DicomImage::getDepth()
• 创建一个具有足够深度的cv::Mat来保存您的数据
• 必要时缩放

Answer 2

在单色DICOM图像上调用DicomImage :: getOutputData（）之前，应确保选择了适当的VOI转换（例如Window Center＆amp; Width）。这可以通过DicomImage :: setMinMaxWindow（），DicomImage :: setWindow（）等来完成。请参阅DicomImage类的文档。

但请注意，DicomImage :: getOutputData（）始终返回渲染的像素数据，即不是存储在DICOM数据集中的原始像素数据。

Answer 3

你需要读取DICOM图像编码中的数据类型转换为opencv类型的Mat。 opencv文档提供有关其Mat标头的完整信息。