如何在将dicom文件转换为jpg文件时设置窗口宽度和窗口中心

时间:2017-06-19 11:30:18

标签: python opencv dicom

我不知道在将dicom文件转换为jpg文件时如何设置Window Width Window Center。

我完成了一个转换器应用程序,它可以通过python和opencv将dicom文件转换为jpg文件。

但它在dicom文件和jpg文件之间有很大的区别,因为我没有设置Window Width和Window Center.However我不知道如何设置它。

Window Center为-400,窗口宽度为1500。

这是我的代码

# -*- coding: utf-8 -*-
#!/usr/bin/python

import os
import cv2
import dicom

def convert_file(dcm_file_path, jpg_file_path):
    dicom_img = dicom.read_file(dcm_file_path)
    img = dicom_img.pixel_array
    cv2.imwrite(jpg_file_path, img)

if __name__ == '__main__':
    rootdir = "D:\CT\A7"

    for parent, dirnames, filenames in os.walk(rootdir):
        for filename in filenames:
            if '.dcm' in filename.lower():
                dicom_path = os.path.join(parent, filename)
                name = dicom_path.replace('\\', '_')[3:]
                jpg_path = "d:\CT_JPG\\%s.jpg" % name
                print (jpg_path)
                convert_file(dicom_path, jpg_path)

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

如果您真的想将DICOM图像保存为jpg,而不是使用窗口宽度和窗口中心参数(如评论中所建议的那样)是为了便于查看,我建议您简单地规范化图像(在int16中)到uint8(这是正常jpg / png / gif图像的比例)。请注意但是,这会导致分辨率的损失。

要将其保存为jpg,一种可能的方法是进行以下修改:

def convert_file(dcm_file_path, jpg_file_path):
    dicom_img = dicom.read_file(dcm_file_path)
    img = dicom_img.pixel_array
    scaled_img = cv2.convertScaleAbs(img-np.min(img), alpha=(255.0 / min(np.max(img)-np.min(img), 10000)))
    cv2.imwrite(jpg_file_path, scaled_img)

如果你想对固定的窗口中心和窗口宽度进行操作,那么

def convert_file(dcm_file_path, jpg_file_path):
    dicom_img = dicom.read_file(dcm_file_path)
    img = dicom_img.pixel_array
    scaled_img = cv2.convertScaleAbs(img-window_center, alpha=(255.0 /window_width)
    cv2.imwrite(jpg_file_path, scaled_img)