I have to compare the overlap or shared regions for 5 bed files and make a venn diagram of the overlapped regions.
I can use pybedtools but it's for 3 files max. Or I found http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
它看起来像一个很好的工具，但我知道如何编码我的数据以找到重叠。
或者有人有R套餐？
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我认为你不能称之为维恩图的要求。 建议一次将比较分解为不超过三个，并使用area proportional ellipses来获得足够好的近似值。 （看起来你的链接是一个类似的工具）
答案 1 :(得分：0)
您添加的链接可以按照您的要求执行，您只需要求它添加更多文件以适合您的五个。
我刚刚使用了＆＃34;列表＆＃34;虽然版本很好，但它确实绘制了五个不同的点，但它需要将它列为每行一个数据点条目。我只是用字母表作为例子。
列出一个:(将其命名为元音）
一
ë
我
0
û （记住每行一个字母）
列表二：猫
C
一
吨
列表三：哭泣
C
[R
ý
现在，点击添加其他列表按钮....
列表四：狗
d
0
克
清单五：鱼
˚F
我
取值
ħ
然后计算，如果滚动到结果的底部，则会获得每个联合的文本特定映射以及内容。
命名总元素 猫元音1 a
猫哭1 c狗元音1 o
鱼元音1 i
cat 1 t
狗2 d 克 元音2 e û 鱼3秒 H ˚F 哭泣2 r ÿ