用于聚类可视化/分析的坐标图

Question

我有一个数据集（已经缩放），共有8列：

• 第一列，表示每个观察所属的指定群集，
• 和7个因变量（每个都在不同的列中）。

我想通过R中的坐标图开发一个聚类可视化，就像下面的博客（http://blog.datascienceheroes.com/short-lesson-on-cluster-analysis/）中所示。

有人可以帮我吗？

Answer 1

许多选择。你可以做到

library(GGally)
ggparcoord(aggregate(mtcars, list(as.factor(cutree(hclust(dist(mtcars)), k = 4))), mean), columns=-1, groupColumn=1)

或

library(parcoords)
parcoords(
  aggregate(mtcars, list(cutree(hclust(dist(mtcars)), k = 4)), mean),
  color = list( colorScale = htmlwidgets::JS('d3.scale.category10()'), colorBy = "Group.1")
)
parcoords(
  transform(mtcars, cluster = cutree(hclust(dist(mtcars)), k = 4)),
  color = list( colorScale = htmlwidgets::JS('d3.scale.category10()'), colorBy = "cluster")
)

Answer 2

您拥有所需功能的代码（plot_clus_coord）here。