读取多个csv文件并获取R中每个csv文件的文件名

时间:2016-03-02 05:28:58

标签: r csv printing ggplot2

我正在尝试读取多个csv文件,并使用ggplot为每个文件做一些绘图。我想使用每个输入文件的文件名打印数字。每个csv文件有6列,但我只绘制1,2,5,6列。

我有一个代码但只适用于单个csv文件:

    dat<-read.csv("D135_tmin.csv",header=TRUE)
    dat$Year<-seq(ymd('1991-01-01'),ymd('2000-12-31'),"days")
    dat2 <- dat[,c(1,2,5,6)]
    names(dat2)[3:4] <- c("P10","P90")
    dat2 <- melt(dat2,id.vars="Year")
    ggplot(dat2[dat2$variable=="Tmin",],aes(Year,value))+
    geom_line(linetype="dashed",color="black",size=0.25)+
    geom_point(data=dat2,aes(Year,value,grp=variable,fill=variable),pch=21,size=2)+
    scale_fill_manual(name="Legend",values=c("Tmin"="dark slate blue","P90"="green","P10"="orange"))
    dev.print(pdf, file="D135_tmin.pdf")

当读取多个csv文件时,我使用以下命令:

     temp=list.files(pattern="*.csv")
     myfiles=lapply(temp,read.table,header=TRUE)

我的问题是,我将阅读100个csv文件,输出pdf应该与输入csv文件同名。

有什么建议吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您是否有理由不想使用for循环?你可以这样做:

 for (i in list.files(pattern="*.csv"){
    dat <- read.csv(i) 
    dat$Year<-seq(ymd('1991-01-01'),ymd('2000-12-31'),"days")
    dat2 <- dat[,c(1,2,5,6)]
    names(dat2)[3:4] <- c("P10","P90")
    dat2 <- melt(dat2,id.vars="Year")
    ggplot(dat2[dat2$variable=="Tmin",],aes(Year,value))+
          geom_line(linetype="dashed",color="black",size=0.25)+
    geom_point(data=dat2,aes(Year,value,grp=variable,fill=variable),
      pch=21,size=2)+
      scale_fill_manual(name="Legend",values=
         c("Tmin"="dark slate blue","P90"="green","P10"="orange"))
     dev.print(pdf, file=sub("csv", "pdf", i))
 }