使用从glmnet中选择的变量提取和改编coxph模型

Question

我想用从glmnet中选择的变量来改编coxph模型。我知道如何从cv.glmnet fit中提取变量名。但是，对于分类数据，变量的原始名称已更改。例如，Sex将成为SexM（或SexF）。任何人都知道如何从glmnet对象中提取原始名称？

Answer 1

如果没有示例，很难准确说出您想要的内容，而是在glmnet＆＃34;变量名称＆＃34;的帮助页面中提供的示例中。返回时间：

(fit1)$beta@Dimnames[[1]]

请注意，示例中的x参数实际上并没有将这些名称作为列名，但是它们被赋予了这样的值，因为x-object是一个矩阵。还有第二组值(fit1)$beta@Dimnames[[1]]。 cv.glmnet返回的对象也可能是您想要的。

将返回它们

fit1_cv$glmnet.fit$beta@Dimnames[[1]] # or [[2]]

一个具体的例子将是最有帮助的。

注意：dimnames(coef(fit1_cv))[[1]]或[[2]]也会取得成功。 （使用正确的提取器功能会更好。