Question

我正在尝试为这些＆＃34;斑点＆＃34;中的每一个设置最小边界框。如下所示。作为图像处理管道的一部分，我使用findContours来检测数据中的轮廓，然后在给定一系列已发现的轮廓的情况下绘制最小边界框。

最小边界框不是很准确 - 有些特征显然是错过的，而其他特征则未能完全覆盖＆＃34;一个完整的连接功能（而是分成几个小的最小边界框）。我已经玩过检索模式（下面显示的RETR_TREE）和轮廓近似方法（CHAIN_APPROX_TC89_L1如下所示），但找不到我真正喜欢的东西。有人可以提出一个更强大的策略来使用OpenCV Python更准确地捕获这些轮廓吗？

import numpy as np
import cv2

# load image from series of frames
for x in range(1, 20):
    convolved = cv2.imread(x.jpg)
    original = convolved.copy

    #convert to grayscale   
    gray = cv2.cvtColor(convolved, cv2.COLOR_BGR2GRAY)

    #find all contours in given frame, store in array
    contours, hierarchy = cv2.findContours(gray,cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_TC89_L1)
    boxArea = []

    #draw minimum bounding box around each discovered contour
    for cnt in contours:
        area = cv2.contourArea(cnt)
        if area > 2 and area < 100:
            rect = cv2.minAreaRect(cnt)
            box = cv2.cv.BoxPoints(rect)
            box = np.int0(box)
            cv2.drawContours(original,[box], 0, (128,255,0),1)           
            boxArea.append(area)

    #save box-fitted image        
    cv2.imwrite('x_boxFitted.jpg', original)
    cv2.waitKey(0)

** 编辑：Per Sturkman的建议，绘制所有可能的轮廓似乎涵盖了所有可视检测的功能。

Answer 1

我知道问题是关于opencv。但是因为我习惯了滑雪，所以这里有一些想法（当然可以在opencv中找到）。

import numpy as np
from matplotlib import pyplot as plt
from skimage import measure
from scipy.ndimage import imread
from skimage import feature
%matplotlib inline

'''
Contour detection using a marching square algorithm.
http://scikit-image.org/docs/dev/auto_examples/plot_contours.html
Not quite sure if this is the best approach since some centers are
biased. Probably, due to some interpolation issue.
'''

image = imread('irregular_blobs.jpg')
contours = measure.find_contours(image,25,
                                 fully_connected='low',
                                positive_orientation='high')
fig, ax = plt.subplots(ncols=1)
ax.imshow(image,cmap=plt.cm.gray)
for n, c in enumerate(contours):
    ax.plot(c[:,1],c[:,0],linewidth=0.5,color='r')

ax.set_ylim(0,250)
ax.set_xlim(0,250)
plt.savefig('skimage_contour.png',dpi=150)

'''
Personally, I would start with some edge detection. For example,
Canny edge detection. Your Image is really nice and it should work.
'''
edges = feature.canny(image, sigma=1.5)
edges = np.asarray(edges)
# create a masked array in order to set the background transparent
m_edges = np.ma.masked_where(edges==0,edges)
fig,ax = plt.subplots()
ax.imshow(image,cmap=plt.cm.gray,alpha=0.25)
ax.imshow(m_edges,cmap=plt.cm.jet_r)


plt.savefig('skimage_canny_overlay.png',dpi=150)

实质上，没有“最佳方法”。例如，边缘检测非常好地检测位置，一些结构保持打开状态。另一方面，轮廓查找产生封闭结构，但中心偏向，您必须尝试使用参数。如果您的图像有一些令人不安的背景，您可以使用扩张来减去背景。 Here是如何进行扩张的一些信息。有时，结账操作也很有用。

从您发布的图片中，您的阈值似乎太高或背景太嘈杂。降低阈值和/或扩张可能会有所帮助。

Answer 2

正如Moritz所建议的那样，尝试使用SimpleBlobDetector。

是个好主意

使用不同的选项，您可能会找到适合您问题的设置。

提高OpenCV Python中findContour的准确性

2 个答案: