Question

我试图找出一个错误，阻止我使用RcppArmadillo制作R包“whyNotWork”。该包只包含一个带有一个简单函数的.cpp文件，该函数返回矩阵的特征值：

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
#include <RcppArmadillo.h>

// [[Rcpp::export]]
arma::vec getEigenValues(arma::mat M) 
{
    return arma::eig_sym(M);
}

在DESCRIPTION文件中，我添加了：

Imports:
    Rcpp (>= 0.12.1), RcppArmadillo
LinkingTo:
    Rcpp, RcppArmadillo
Depends: RcppArmadillo

在NAMESPACE文件中，我添加了：

exportPattern("^[[:alpha:]]+")
useDynLib(whyNotWork)
import(RcppArmadillo)
importFrom(Rcpp, evalCpp)

如果我没有尝试创建一个包，该函数可以正常工作 - “源”按钮将成功加载该函数并且它可以正常工作。但是，在制作包时，点击“Build＆amp; Reload”按钮会出现以下错误：

arma.o：arma.cpp（$的.text _ZN4arma6auxlib7eig_symIdNS_3MatIdEEEEbRNS_3ColIT_EERKNS_4BaseIS5_T0_EE [_ZN4arma6auxlib7eig_symIdNS_3MatIdEEEEbRNS_3ColIT_EERKNS_4BaseIS5_T0_EE] + 0x28d）：对`dsyev _'
的未定义引用

我用谷歌搜索“dsyev”，它似乎与LAPCAK有关..

解决方案：

src文件夹中的新.txt文件。添加

PKG_LIBS = $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

在文件中。

将txt文件重命名为Makevars.win（如果它不是Windows系统，则不是.win）。包装成功。

通过比较RcppArmadillo.package.skeleton()生成的文件和Rstudio

生成的文件，找到解决方案

Answer 1

您的操作系统是什么？

R CMD config LAPACK_LIBS返回什么？

您是自己构建R还是下载了二进制文件？

在大多数系统（Linux，OS X，...）上，R将使用外部LAPACK库。在Windows上，它可能使用自己的（减少的）LAPACK副本，但缺少某些功能。

对于它的价值，你的程序在我的系统上使用外部LAPACK库构建得很好：

R> sourceCpp("/tmp/arma_sym.cpp")
R> v <- 1:4; getEigenValues(v %*% t(v))  
             [,1]
[1,] -2.33587e-15
[2,]  0.00000e+00
[3,]  2.33587e-15
[4,]  3.00000e+01
R>

在Rstudio中使用RcppArmadillo制作R包符合错误“对dsyev的未定义引用”

1 个答案: