Question

我正在尝试编译在RStudio中使用RcppArmadillo的Rcpp软件包。我只是想编译：

#include <RcppArmadillo.h>
// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]

using namespace Rcpp;

// Implementation of MASS' rmvrnorm()

// [[Rcpp::export]]
arma::mat rmvrnorm_arma2(int n, arma::vec mu, arma::mat sigma) {
   int ncols = sigma.n_cols;
   arma::mat Y = arma::randn(n, ncols);
   return arma::repmat(mu, 1, n).t() + Y * arma::chol(sigma);
}

可在此处找到：http://gallery.rcpp.org/articles/simulate-multivariate-normal/

我已将文件rmvrnorm_arma.cpp放在/ src /目录中。

RStudio提供以下错误：

==＆GT; RCPP :: compileAttributes（）

警告消息：使用引用以下包   Rcpp :: depends属性但未在Depends中列出   LinkingTo包的描述文件：RcppArmadillo

==＆GT; Rcmd.exe INSTALL --no-multiarch --with-keep.source Choice38


安装到图书馆＆＃39; F：/ Program Files / R / R-3.1.0 / library＆＃39;

安装源包＆＃39; Choice38＆＃39; ... g ++ -m64 -I＆＃34; F：/PROGRA~2/R/R-31~1.0/include" -DNDEBUG -I＆＃34; F：/ Program Files / R / R-3.1.0 / library / Rcpp / include＆＃34;   -I＆＃34; d：/ RCompile / CRANpkg / extralibs64 /本地/包括＆＃34; -O2 -Wall -mtune = core2 -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o   ** libs RcppExports.cpp：9：1：错误：＆＃39; arma＆＃39;没有命名类型RcppExports.cpp：在函数＆＃39; SEXPREC * Choice38_rmvrnorm_arma（SEXP，   SEXP，SEXP）＆＃39;：RcppExports.cpp：16：40：错误：＆＃39; arma＆＃39;未被宣布   此范围RcppExports.cpp：16：50：错误：模板参数1是   无效的RcppExports.cpp：16：58：错误：在＆＃39; mu＆＃39;之前的预期初始化程序   RcppExports.cpp:17:50：错误：参数1中的类型/值不匹配   ＆＃39;模板结构的模板参数列表   RCPP ::特点:: input_parameter＆＃39; RcppExports.cpp:17:50：错误：
  期待一种类型，得到了arma＆＃39; RcppExports.cpp:17:58：错误：预期   初始化程序之前的sigma＆＃39; RcppExports.cpp：18：9：错误：＆＃39; arma＆＃39;不是   一个类或命名空间RcppExports.cpp：18：19：错误：预期＆＃39 ;;＆＃39;之前   ＆＃39; __结果＆＃39; RcppExports.cpp：19：9：错误：＆＃39; __结果＆＃39;未被宣布   此范围包含： * [RcppExports.o]错误1警告：运行命令   ＆＃39; make -f＆＃34; F：/PROGRA~2/R/R-31~1.0/etc/x64/Makeconf" -F   ＆＃34; F：/PROGRA~2/R/R-31~1.0/share/make/winshlib.mk"   SHLIB_LDFLAGS =＆＃39; $（SHLIB_CXXLDFLAGS）＆＃39; SHLIB_LD =＆＃39; $（SHLIB_CXXLD）＆＃39;   SHLIB =＆＃34; Choice38.dll＆＃34; WIN = 64 TCLBIN = 64 OBJECTS =＆＃34; RcppExports.o   rmvrnorm_arma.o＆＃34;＆＃39;状态为2 ERROR：包的编译失败   ＆＃39; Choice38＆＃39;

删除＆＃39; F：/ Program Files / R / R-3.1.0 / library / Choice38＆＃39;


退出状态1.

我不确定为什么Rcpp / Rstudio拒绝注意cpp文件顶部的包含和依赖语句rmvrnorm_arma

如果我尝试使用源加载.cpp，我会在第一次加载它时收到以下错误：

Rcpp :: sourceCpp（＆＃39; rmvrnorm_arma.cpp＆＃39;）警告信息：In   normalizePath（path.expand（path），winslash，mustWork）：
  path [1] =＆＃34; F：/ Documents / BoxSync / Choice Project / R Scripts / Rcpp   Scripts / RcppArmadillo MCMC / Choice38 / src /../ inst / include＆＃34;：系统   找不到指定的路径

在第二次加载它时，拾取源。

在开始在Rstudio中以rcpp包模式开发之前，我对sourceCpp（）没有任何问题。

Answer 1

[[Rcpp::depends(...)]]功能适用于sourceCpp()等，对于您应使用Imports:和Depends:等pp字段来设置软件包的软件包。

我认为现在对RStudio存在轻微的错误/麻烦，因为您可能需要交换DESCRIPTION中的字段以消除第一个警告。但它起作用了。

考虑使用我们提供的功能设置包：RcppArmadillo.package.skeleton()并从那里开始。

编辑：当然，另一种方法是使用RcppArmadillo加载65个CRAN软件包中的任何一个并在RStudio中构建它然后比较它们的设置（基本上：Depends / Imports和LinkingTo，以及正确的NAMESPACE文件）到你现在拥有的东西，所以看看你缺少什么。

如何使用RcppArmadillo在Rstudio中构建Rcpp包？

1 个答案: