Question

我正在使用macOS High Sierra版本10.13.4。在安装“RcppArmadillo”软件包时，我收到以下两条警告消息：

   checking whether /usr/local/clang6/bin/clang++ -Wall accepts -g... (cached) yes
   checking whether g++ version is sufficient... almost
   configure: WARNING: Compiler self-identifies as being compliant with GNUC extensions but is not g++.
   checking for macOS... found
   checking for macOS Apple compiler... not found
   checking for clang compiler... found
   checking for OpenMP compatible version of clang... found and suitable
   checking LAPACK_LIBS... R-supplied partial LAPACK found
   configure: WARNING: Some complex-valued LAPACK functions may not be available

当我在终端上输入“gcc --version”时，我得到了

 Configured with: --prefix=/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/usr --with-gxx-include-dir=/usr/include/c++/4.2.1
 Apple LLVM version 9.1.0 (clang-902.0.39.2)
 Target: x86_64-apple-darwin17.5.0
 Thread model: posix
 InstalledDir: /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin

我在R中的Makevars文件看起来像：

FLIBS=-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin16/6.3.0 -L/usr/local/gfortran/lib -lgfortran -lquadmath -lm
F77 = /usr/local/bin/gfortran
FC = $F77
CXX =  /usr/local/clang6/bin/clang++  -Wall
LDFLAGS=-L/usr/local/clang6/lib
CC=  /usr/local/clang6/bin/clang
SHLIB_CXXLD=ccache /usr/local/clang6/bin/clang++
CXX11 =  /usr/local/clang6/bin/clang++
CXX98 =  /usr/local/clang6/bin/clang++
CXX14 =  /usr/local/clang6/bin/clang++

如何删除这两个警告标志？

Answer 1

简而言之，这些是警告和不错误。此外，这些警告不很重要。

让我们谈谈每个警告的含义......

第一次警告

configure：警告：编译器自我识别为符合GNUC扩展但不是g ++。

这表明Makevars文件的CXX变量中定义的编译器将标识为gcc但是不是< / em> gcc编译器。实质上，每个编译器都有自己的预定义标头，请参阅Section 3.7.2 Common Predefined Macros的The C Preprocessor，此检查的重点是验证是否选择了现代gcc编译器。但是，如果编译器在说谎是谁，那么很难检查编译器是否存在。

有关原点的详细信息，请参阅问题Add a check message success in config after g++version check #183和提交the default message on the g++ test）中的讨论。

第二次警告

configure：警告：某些复值LAPACK函数可能不可用

在此警告中，有人抱怨基础Linear Algebra PACKage与 R 附带的the check searches for相同。不幸的是， R 附带的LAPACK 严重受限制且有点过时。因此，这里的检查是希望通过OpenBLAS，Intel MKL或ATLAS存在外部 LAPACK。由于此检查的结构方式，除非您从源代码编译 R - 即您选择不使用CRAN提供的二进制文件 - 否则无法避免打嗝。

简单地说，CRAN二进制文件在特定位置查找LAPACK。切换到另一个LAPACK需要建立到现有lRlapack位置的符号链接，这是Section A.3 Linear algebra。但是，做这样的符号链接并不可取。（对不起vecLib爱好者！）

如果您对从源代码编译感兴趣，请考虑查看R Installation and Administration {{3}}，其中介绍了使用外部LAPACK的过程。

在R中安装“RcppArmadillo”软件包时出错

1 个答案:

第一次警告

第二次警告