与允许一定数量的错误匹配的最大精确匹配

Question

我正在为这个问题寻找一种有效的算法。

1.给出两个字符串（m，n），第一个字符串的长度比第二个字符串长（第一个通常用作长度为100的查询，第二个用于100,000,000个字符。< / p>

2.第二个字符串中第一个字符串的所有最大精确匹配也作为两个字符串中的间隔向量给出。 n中子串的多次出现的可能性随着该子串的大小的减小而增加。

问题是找到m和n中最大的公共区间，允许一定数量的不匹配，如p。

图片

中的示例