使用Heatmap.2创建Heatmap

Question

嗨大家：请原谅我的无知，因为我在R中完全是新手，但我正在尝试使用heatmap创建热图。我可以创建地图，但边距和行标签在页面上看起来像一个大的黑色涂抹，我不知道我做错了什么。此外，默认行为是将行标签放在右侧，我希望它们在左侧。

我正在使用的代码是：

    mycolors<-c("green","grey","red")

    #no clustering or reordering


    heatmap.2(WIDEMAT,col=mycolors,
      dendrogram="none",
      key=F,
      Colv="NA",
      Rowv="NA",
      main="NQF DATA",
      xlab="Subject ID",
      ylab="")

非常感谢任何提示

Answer 1

也许您可以查看d3heatmap包。另外正如@ 42所提到的那样你可以dput(WIDEMAT)并在这里打印输出

rm(list = ls())
library(d3heatmap)
d3heatmap(mtcars, scale = "column")