.fasta和.genbank格式之间的文件转换

时间:2015-10-16 09:12:57

标签: python fasta genbank

我必须创建两个函数,这些函数应该允许我打开<div ng-include src="tplName" highlight-search-terms="something to highlight"></div> 文件并将它们转换为.genbank文件,反之亦然。我现在拥有的是:

.fasta

这也可能不正确,但我不知道该怎么做。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您可以在互联网上找到大量有关此内容的文档。看看这里:https://docs.python.org/2/tutorial/inputoutput.html#reading-and-writing-files

但要让你开始: 我假设将来两个文件不一样,否则你只能复制文件。

我有几点评论。

1)你的循环while true将一直运行到时间结束。将其更改为

for line in handle_input:

2)完成后关闭文件:

handle_input.close() handle_output.close()

3)t=handle_output.write(s, '.genbank') 删除&#39; .genbank&#39;参数

4)无需print(t)

注意:我没有测试过这段代码,所以我可能会犯一些小错误