使用Python(dendroPy或其他库)加入2棵树

时间:2015-10-10 21:31:35

标签: python bioinformatics phylogeny

我正在使用Python库(Bio.Phylo和DendroPy)研究系统发育。

我必须以Newick格式导入2棵树(这显然不是困难部分)并将它们连接在一起,更确切地说,我必须在另一棵树的一个尖端/叶子上添加一棵树。

我尝试使用 DendroPy 中的add_childnew_child方法,但没有成功。

我该如何解决这个问题?

1 个答案:

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没有诉诸任何比编辑更漂亮的东西 你可以在tree1中找到你的“tip”并在那一点插入tree2的字符串。 (作为嵌套集和所有)