Dendropy interpop模块python

Question

我目前正在尝试使用python Dendropy库并在我的代码中包含一些PAUP命令。

我正在使用python library中提到的教程，但它给了我一个错误。

所以我正在做的是我正在尝试从距离矩阵估计一棵树：

距离矩阵A（Numpy数组）

[[ 0  2  7  8 16 17]
 [ 2  0  5  6 17 16]
 [ 7  5  0  9 15 13]
 [ 8  6  9  0 18 16]
 [16 17 15 18  0  5]
 [17 16 13 16  5  0]]

import dendropy
from dendropy.interpop import paup     

#A is a distance matrix like this    

tree = paup.estimate_tree(A, 'nj')

我得到的错误是：ImportError: No module named interpop

我的机器上安装了PAUP，教程没有讨论安装任何其他模块。

任何帮助都将不胜感激。

修改 的 这适用于NUMPY数组？因为它似乎给numpy数组一个错误..以及如何解决这个问题??

Answer 1

尝试使用from dendropy.interop import paup（减去p中的interpop）。我错误输入两次写这个答案，所以如果这是错误的原因那么这是可以理解的：）