三维矩阵的R /交叉相关中的共定位

时间:2015-06-29 11:34:07

标签: r matrix cross-correlation

我希望以前没有问过,但我目前正在分析R中的一些显微镜图片,我不太清楚如何解决这个问题。

情况如下: - 我在细胞中有几张不同目标的照片,显示信号斑点 - 有些图片显示相同的单元格,但是在其他图片之后被获取,因此在x,y和z方向上有点“关闭” - 有些,但绝不是所有的照片都显示共定位=一张照片中的斑点也出现在其他照片上

来自现场检测软件,我现在拥有每张图片中所有斑点的数据帧(每张图片一张df),带有x,y和z坐标。

我正在寻找

a)从不同颜色中对齐这些斑点矩阵的方法,并认为矩阵的互相关可能是一种方法(但是,R中的3D是否存在CC?)

b)计算共定位的方法。由于这些是图片并且本质上是嘈杂的,甚至共定位的点可能具有稍微不同的坐标。 R中是否有包的功能,它根据我选择的阈值或其他参数合并这些数据?

提前感谢您的所有答案! 西蒙

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