不同矩阵之间的相关性R.

Question

我试图在R

中创建两个不同矩阵（运算分类单位与环境参数）之间的相关性（带p值）

第一个表是这个

biotic1 biotic2 T1 1.540184 3.080025 T2 1.354927 5.012977 T3 1.449712 4.715981 T4 1.146659 2.442083 X1 1.705184 3.881878 X2 1.182721 3.014836 X3 1.536956 2.636719 X4 1.808025 4.434525 A1 1.132737 2.135737 A2 1.506048 3.114281 A3 1.285308 4.363828 A4 3.008994 7.290423

和第二个表

OTU1 OTU2 OTU3 OTU4 OTU5 OTU6 OTU7 OTU8 T1 109 80 175 14 71 46 61 39 T2 102 48 26 8 23 5 35 10 T3 26 19 61 3 68 13 10 29 T4 143 56 9 11 16 13 49 24 X1 70 36 20 15 39 9 26 12 X2 39 33 12 32 15 2 11 3 X3 43 17 2 14 8 2 7 2 X4 160 60 8 26 25 7 9 15 A1 90 73 41 15 22 23 33 7 A2 344 109 18 28 22 13 93 16 A3 65 16 15 9 5 10 18 6 A4 141 140 6 86 18 3 43 4

我已经尝试过cor（）和corr.test（），但它只能关联来自第一个表的值

有什么建议吗？

非常感谢

˚F

Answer 1

我不清楚您期望得到什么结果。但是，如果您想要执行简单的相关性测试，则必须使用矢量格式的矩阵。您可以尝试以下方式：

cor(c(as.matrix(your_matrix1)), c(as.matrix(your_matrix2)))

或

cor.test(c(as.matrix(your_matrix1)), c(as.matrix(your_matrix2)))

并查看其中一个选项是否符合您的期望。

然而，通过规范相关分析探索数据集对我来说更有意义。使用base R你可以使用：

cancor(matrix1, matrix2)

您还可以使用一些包含一组工具来解释结果的包（例如library(CCA)）