Question

我尝试将Java插件写入ImageJ，它应该：

加载图像（24位）。
进行一些预处理操作。
以多种方法对图像进行阈值处理。
做一些其他操作。

我的阈值操作有问题。我的部分代码如下所示：

Opener opener = new Opener();
ImagePlus imp = opener.openImage(source);
// Preprocessing
IJ.run("Threshold..." , method);
// Other operations e.g. "open", "outline" etc.
IJ.saveAs(destination);

我的目标是以各种方法获得二值化图像（例如＆＃34;默认＆＃34;，＆＃34;黄＆＃34;，＆＃34; Intermodes＆＃34;，＆＃34; IsoData＆＃34; ，＆＃34;李＆＃34;等）。只有我可以获得二值化图像的方法是运行：

IJ.run(imp, "8-bit", "");
IJ.run(imp, "Make Binary", "");

然而，我只用一种方法得到一个二值化的图像。如何通过运行Java代码（ImageJ插件）来实现自动阈值？

Answer 1

您似乎以错误的方式使用IJ.run方法。第一个参数是包含ImageJ命令的字符串，第二个参数是包含此命令选项的字符串。来自文档：

public static void run（java.lang.String命令，                          java.lang.String options）

运行一个ImageJ命令，其中包含传递给的选项   GenericDialog和OpenDialog类。直到没有回来   命令已完成执行。要生成run（）调用，请启动   记录器（插件/宏/记录）并从ImageJ菜单运行命令   杆

您还可以使用GUI记录宏，Plugins->Macros->Record...，将记录模式设置为Java ，并选择所需的方法和阈值。你会得到这样的东西：

// Color Thresholder 1.49i
// Autogenerated macro, single images only!
min=newArray(3);
max=newArray(3);
filter=newArray(3);
a=getTitle();
run("HSB Stack");
run("Convert Stack to Images");
selectWindow("Hue");
rename("0");
selectWindow("Saturation");
rename("1");
selectWindow("Brightness");
rename("2");
min[0]=139;
max[0]=254;
filter[0]="pass";
min[1]=48;
max[1]=110;
filter[1]="pass";
min[2]=189;
max[2]=255;
filter[2]="pass";
for (i=0;i<3;i++){
  selectWindow(""+i);
  setThreshold(min[i], max[i]);
  run("Convert to Mask");
  if (filter[i]=="stop")  run("Invert");
}
imageCalculator("AND create", "0","1");
imageCalculator("AND create", "Result of 0","2");
for (i=0;i<3;i++){
  selectWindow(""+i);
  close();
}
selectWindow("Result of 0");
close();
selectWindow("Result of Result of 0");
rename(a);
// Colour Thresholding-----------------

Answer 2

Threshold dialog中的自动阈值方法都是处理单通道（8位或16位）图像的算法。在Color Threshold对话框中，它们专门应用于24位彩色图像的亮度通道。

要在Java中重现此内容，请使用以下代码：

IJ.run(imp, "HSB Stack", "");
imp.setSlice(3);
IJ.setAutoThreshold(imp, "Triangle dark");
Prefs.blackBackground = true;
IJ.run(imp, "Convert to Mask", "only");

（将图像转换为8位只不过是使用亮度通道，丢弃色调和饱和度信息。除非您真正使用颜色阈值中的其他滑块对话框，您也可以在应用阈值之前将图像转换为8位。）

ImageJ（插件Java）：自动阈值方法不起作用

2 个答案: