如何在Sweave PDF报告中包含shell命令结果？

Question

我需要在Sweave PDF报告中包含shell调用的结果和报告，但我在块参数中找不到任何参数。

例如，当我应用以下代码时：

> system(" makeblastdb -in mouseX.fasta -dbtype nucl -parse_seqids -out mouseXdb")

报道：

Building a new DB, current time: 05/01/2015 18:31:57
New DB name:   mouseXdb
New DB title:  mouseX.fasta
Sequence type: Nucleotide
Keep Linkouts: T
Keep MBits: T
Maximum file size: 1000000000B
Adding sequences from FASTA; added 1 sequences in 1.08783 seconds.

但是当我使用print或echo等参数时，它不会出现在Sweave Report中

作为另一个例子，我可能希望使用对header命令的shell调用在报表中包含文件的标题。