Question

我正在研究R包的插图，在很多情况下，我想在文档中包含错误输出作为用户的示例。

所以Sweave代码块

<<throws_error>>=
 stop('hello')
@

理想情况下会生成一个带有

的文档

stop('hello')
Error: hello

我的真实例子是一个相当长的运行过程，我想捕获警告和消息的输出以及错误。

我已经搞砸了各种Sweave代码块，包括params。我提出的唯一解决方案是使用隐藏的代码块来打印带有cat()的错误文本 - 这会破坏使用Sweave的目的。似乎可能有sink()函数可能以某种方式重定向stderr的解决方案，但是也无法解决这个问题。有什么建议吗？

Answer 1

您是否使用Sweave或knitr生成LaTeX和pdf文件？

默认使用RStudio下的knitr，生成的文档几乎就是您想要的内容。

在Sweave下，您可以使用以下解决方法，取自this message on R-help：

%outputs the R code but does not execute it. So no error
<<echo=TRUE, eval=FALSE>>=
 stop('hello')
@

% executes the code but displays only the error
<<echo=FALSE, eval=TRUE>>=
cat(try(stop('hello')))
@

如何在Sweave文档中包含R stderr输出

1 个答案: