Question

我遇到以下代码段的问题：

\documentclass{article}
\usepackage{graphicx}
\begin{document}
\includegraphics{myscatterplot.pdf}
\end{document}

其中“myscatterplot.pdf”由R中的以下代码生成：

library(scatterplot3d)
pdf("myscatterplot.pdf")
scatterplot3d(rnorm(100), rnorm(100), 1:100, highlight.3d = TRUE)
dev.off()

问题在于，使用texworks（pdfLatex + makeindex + bibtex）进行编译时生成的LaTeX文档具有图形轴，但绘图或轴标签中没有任何点（在这种情况下，它只是3d轴本身）。 R或LaTeX不输出错误或警告消息。我正在使用：

Windows 7上的R 2.12.1，
MiKTeX 2.8，
TEXworks的
Adobe Reader 9（不确定是否这样有关...）

我已经能够使用\ includegraphics命令包含该图的png版本，并用adobe打开“myscatterplot.pdf”，在我的文档中显示我想要的数字。

我曾尝试使用tikz软件包作为解决方法，但似乎scatterplot3d生成了太多信息，由于内存大小，生成的图形无法包含在乳胶文档中（错误（我的实际情节将有10000） +分！）。

我怀疑问题是由于“.pdf”文件中的字体造成的，但我尝试使用

更改pdf字体

pdf("changefont.pdf")
par(family = "Helvetica")
scatterplot3d(rnorm(100), rnorm(100), 1:100, highlight.3d = TRUE)
dev.off()

使用\ includegraphics（changefont.pdf）时的结果完全相同。

我正在考虑的另一个可能的问题是，scatterplot3d输出实际上可能是多个图像，而\ includegraphics只是从pdf文件中获取第一个数字（轴）。在这种情况下，我仍然不确定如何解决它。

我真的很感谢一种解决方法，因为我最终希望用Sweave完成所有这一切，这让我对包装的其他优美输出感到痛苦！

提前感谢您的回复。

编辑1：

因此，第一个建议是使用EPS格式而不是pdf。这产生了一些结果，但不是我想要的结果。我运行了以下内容：

\documentclass{article}
\usepackage{graphicx,epstopdf}
\begin{document}
\begin{figure}
\includegraphics[angle = 270, width= 6in, keepaspectratio=true]{change.eps}
\end{figure}
\end{document}

我使用

生成了“change.eps”

postscript("change.eps")
scatterplot3d(rnorm(100), rnorm(100), 1:100, highlight.3d = TRUE)
dev.off()

这个确实产生了一个改进（尽管奇怪的是，它在乳胶输出中顺时针旋转了90度！），我现在有了散点图中的轴和点在我的乳胶输出！但是，即使我使用ghostview打开了“change.eps”，轴标签仍然没有出现在图中！似乎scatterplot3d输出数字的方式与\ includegraphics搜索数字的方式不一致......

所以，我仍然在寻找一个包含轴标签的解决方案。

Answer 1

查看使用您列出的命令生成的myscatterplot.pdf，轴和标签就在那里。但是，pdf相当大（7英寸x 7英寸）。

如果你使用pdf（）的重量/身高参数会有帮助吗？

pdf("myscatterplot.pdf", height=3.5, width=3.5)

Answer 2

这是与LaTeX超出其可用内存相关的附注。

我刚用tikzDevice的例子来做一些压力测试，看起来结果很大程度上取决于使用哪个TeX引擎。特别值得注意的是luatex，pdftex的后继者，证明能够处理具有许多图形元素的图。

pdflatex：

通过1000点积累，超过记忆并在10,000点死亡。
xelatex：

也超过记忆而死于10,000点。
lualatex：

在~45秒内咀嚼10,000点并产生1 MB的PDF文件。在~7.5分钟内登录100,00点（一个10 MB的输入文件），吐出一个8.5 MB的PDF文件，达到~750 MB的内存使用率。没有尝试100万基准。

看起来pdftex和xetex在程序登陆时预先分配所有内存，这就是他们将获得的全部内容。另一方面，luatex似乎可以动态分配内存，因此只受可用RAM量的限制。

因此，如果pdflatex给您“内存不足”错误，请尝试lualatex进行旋转！

这些测试是使用TeX Live 2010发行版中包含的TeX编译器完成的。我也是tikzDevice

的作者之一

Answer 3

您可以尝试Sweave：http://www.statistik.lmu.de/~leisch/Sweave/（Sweave是一个允许嵌入R代码以在乳胶文档中进行完整数据分析的工具）

Answer 4

如果你想在你的文件中插入pdf图像，我认为你必须使用pdflatex而不是标准乳胶。如果没有安装，我会尝试从R生成eps格式的数字，而不是pdf。

Answer 5

我回忆起类似问题的挣扎。不记得我是否能在图中看到标签。回顾一下代码，我在R级修改了两个参数：

par(xpd=NA)
par(oma=c(3, 3, 0, 0))

也适用于postscript，以便不将图形旋转90度：

postscript(file="xx.eps", horizontal=FALSE)

HTH

Answer 6

我实际上遇到了完全相同的问题（TexWorks，pdfLatex，Windows 7）。我发现了一些有趣的东西：当我第一次启动Latex时，数字出现了轴和所有，当我重新运行pdfLatex时，轴再次消失。这给了我一个预感，我想出来了：即使乳胶预览没有显示轴，PDF格式也是如此。而且您甚至不必告诉\includegraphics命令图形是PDF格式。

pdf("C:/Users/Orr/Documents/Leiden University/Master thesis/Chapters/Images/bioRes/Boxplots mouse raw data.pdf")
boxplot(mouse_data_raw,main="Mouse raw data")
dev.off()

\begin{figure}[t]
\includegraphics[scale=0.5]{mouse-box-raw}
\includegraphics[scale=0.5]{human-box-raw}
\end{figure}

如何在LaTeX文档中包含复杂的R图？

6 个答案:

这是与LaTeX超出其可用内存相关的附注。