Question

我想拍摄嘈杂的2d数据并使用LOESS平滑来找到更平滑的2D表面。数据是r行和c列的数据帧或矩阵的形式。＆＃39; asbio＆＃39;包将为n * n数据做表面图，我可以弄清楚如何用1D拟合＆＃39;黄土＆＃39;从统计学基础包，但我不知道如何做2D图。

library(rgl)


age <- 1:100
year <- 1959:2012
z<- data.frame(matrix(array(0, length(age)*length(year)),nrow=length(age), ncol=length(year)))
rownames(z) <- age
colnames(z) <- year
distYear <- dnorm(1:length(year), 26, 10)
distAge <- dnorm(age, 50, 15)
for(theYear in year){
  #for(theAge in age){
    z[,theYear-year[1]+1] <- as.numeric(distYear[theYear-year[1]+1]*distAge*runif(length(age))*50000)
  #}
}
z<- data.matrix(z)
z <- data.frame(z)
colnames(z) <- year

# First define the colours for the Z values.
zlim <- range(z)    
zlen <- zlim[2] - zlim[1] 
scale <- 20/zlen
colorlut <- terrain.colors(20,alpha=1.0) # height color lookup table
col <- colorlut[ (t(as.matrix(z))-zlim[1])*scale+1 ] # assign colors to heights for each point.


surface3d(age,year,as.matrix(z), col=col)

loess(z~age+year,data=data.frame(z))

我收到一个错误，拒绝将data.frame作为列表，但我怀疑它还有更多。搜索信息时，我只能找到一维线性描述。

有人可以帮忙吗？

Answer 1

解决了....

需要将数据帧或矩阵转换为三列数据帧。创建上面的数据框z后，以下内容将平滑并显示它（使用rgl）。

open3d(useFreeType=par3d("useFreeType"))
surface3d(age,year,as.matrix(z), col=col)

zz <- z 
zz$Ages <- rownames(z)
zzx <- melt(zz, id.vars="Ages", value.name="Vals")

theResult <-     loess(Vals~as.numeric(Ages)+as.numeric(variable),data=data.frame(zzz))
resultTable <- matrix(theResult$fitted, nrow=length(age), length(year))

open3d(useFreeType=par3d("useFreeType"))
surface3d(age,year,as.matrix(resultTable), col=col)

在R中使用LOESS拟合2d表面

1 个答案: