R中的指示物种分析(labdsv包)

时间:2015-04-20 02:08:26

标签: r statistics

我正在使用包labdsvindval函数

的指标物种分析

我是R的新手并且之前正在让ISA工作,但现在我的应用数据正在抛弃这个我似乎无法解决的错误。我想知道是否有人可以帮助我。

我有一个主题x OTU表(26 x 345)OTU在列中,行是主题。

我的分组文件也附有每个科目的成员资格1(治愈)或2(复发)

Subject Groups
    101      1
    102      1
    104      1
    107      1
    108      1
    109      1
    110      1
    112      1
    113      1
    116      1
    122      1
    124      1
    125      1
    126      1
    128      1
    129      1
    134      1
    103      2
    105      2
    114      2
    117      2
    120      2
    130      2
    131      2
    133      2

当我运行indval分析时,我始终遇到此错误。我似乎无法从那些收到类似错误的消息组中了解任何内容。

  

sort.list(y)出错:' x'对于' sort.list'必须是原子的   你有没有打过电话'排序'在名单上?

这是我的代码和后续错误

library(labdsv)
family=read.delim("clipboard", row.names=1)
groupings=read.delim("clipboard", row.names=1)
out=indval(family,groupings, numitr=10000)

Error in sort.list(y) : 'x' must be atomic for 'sort.list'
Have you called 'sort' on a list?

0 个答案:

没有答案