R中稀有的特殊物质

时间:2015-03-27 10:08:18

标签: r plot vegan

我对R中rarefaction功能中的specaccum方法有疑问。

我有以下数据集

Species1  Species2 Species3 ... Species75
10        20       5        ... 7

我试图绘制一条曲线,在x轴上绘制个体数量,在y轴上绘制物种数量(在上面的例子中应该导致75)。

我试图将其绘制如下:

plot(specaccum(dataset, method="rarefaction", xvar="individuals"))

但我一无所获。 有人能帮助我吗?

非常感谢

Victor D。

1 个答案:

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我遇到了同样的问题,尝试创建一个我使用chao1方法的对象,放置你喜欢的东西,然后单独绘制

sac< - specaccum(数据集,方法="稀疏",gamma =" chao1")

plot(sac,add = FALSE,random = FALSE,ci = 2,ci.type = c(" polygon"),col = par(" fg"),xvar = c("个人"))

请参阅http://127.0.0.1:12380/library/vegan/html/specaccum.html以确保