我正在尝试使用代码中的纯素包的specaccum函数中的稀疏方法为两种不同的栖息地类型生成稀薄物种积累曲线:
spa <- specaccum(Example, method = "rarefaction")
该函数适用于一个数据集,但不适用于产生此错误的另一个数据集:
Error in rarefy(t(freq), ind[i], se = TRUE) :
function accepts only integers (counts)
但是,数据布局与其他数据集完全相同,当我调查数据框时,它表示该物种的所有数据都是整数形式。
这是数据框的一个小得多的部分:
Site AA AB AC AD AE AF AG AH AI AJ AK AL
1.1 0 0 0 0 1 0 0 2 0 0 0 0
1.2 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
1.3 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.1 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
2.2 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
2.3 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 1 1
3.2 0 2 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0
3.3 0 0 0 0 2 0 0 3 0 0 0 0
4.1 0 0 0 0 0 0 1 1 0 0 0 0
4.2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
4.3 0 0 0 0 1 0 0 1 0 0 0 0
5.1 0 1 0 0 0 1 0 3 0 0 0 0
5.2 0 0 1 0 2 0 0 1 0 0 0 0
5.3 0 0 0 1 3 2 0 4 0 0 0 0
6.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
6.2 0 2 2 0 0 2 0 0 0 0 0 0
6.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
站点是栖息地内的采样点,字母表示物种。我不确定为什么它适用于一组数据而不是另一组数据,如果它们都像这样布局。有人可以帮我理解吗?
由于