Bowtie2环境变量

时间:2015-03-26 16:34:10

标签: macos bioinformatics

我完全迷失了bowtie2个环境变量。我使用的是Mac,我下载了bowtie2-2.2.5的源文件并执行了"make"

找到此文件夹的绝对路径是

/Users/Lab/Documents/CLI_Programs/bowtie2-2.2.5/

我希望能够运行命令bowtie2,而不必位于包含此命令的文件夹中。我尝试使用

更改.bash_profile
export BT2_HOME=/Users/Kumka/Documents/CLI_Programs/bowtie2-2.2.5/

我不知道这应该是什么样的......当我在文件夹中运行./bowtie2时,最后一行是

(ERR): bowtie2-align exited with value 1

甚至编译得正确吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

open ~/.bashrc

将以下路径添加到.bashrc并保存

PATH=$PATH:/Users/lab/Documents/CLI_Programs/bowtie2-2.2.5

他们为什么不用一个例子来明确表达...... Geez