找不到MetaPhlaAn2

时间:2018-10-13 04:27:55

标签: python

我正在尝试从https://bitbucket.org/luo-chengwei/constrains运行ConStrains算法。 我将Constrains克隆到$ HOME中。然后我运行了代码,并收到如下错误消息:


code and error message


我的metaphlan数据库位于

$HOME/metaphlan2/metaphlan_databases.
Line 586 of ConStrains.py
来自站点https://bitbucket.org/luo-chengwei/constrains

给我错误。我的PATH如下所示:


  

/home/mathed/miniconda2/bin:/home/mathed/bin:/home/mathed/.local/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr / bin:/ sbin:/ bin:/ usr / games:/ usr / local / games:/ snap / bin:/ home / mathed / metaphlan2:/ home / mathed / metaphlan2 / utils:/ home / mathed / repos / bowtie2


如何找到它?谢谢。

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