Question

我正在使用ODE求解器来解决我的ODE系统。现在我还想通过改变它们来计算各种参数的灵敏度。我的基本ODE求解程序类似于：功能：

function F = ODE_site(t,y)
%%Parameter block
k1f=1e8;
k1b=1e5; %%and so on

%%Elementary rate block
r1=k1f*y(1)-k1b*P*y(5);
and so on

%%Mass balance block
F=[  r1-r5-r78+r86 ;
    and so on ];
%% End of function

主ODE求解器如下所示：

optode = odeset('NonNegative',1:41,'Abstol',1E-20,'RelTol',1E-20);
y0=zeros(41,1);
y0(41) = 1;
[t,y]=ode15s(@ODE_site,[0,50000000000],y0,optode);
%% Plus some other lines to plot the solution
%% End of ODE solver

现在，我想在主解算器中引入for循环，但问题是如果我在主解算器中使用for循环，它就无法将命令传递给函数。我尝试使用global将变量分配给整个环境，但它没有用。如何为ODE求解器代码和函数分配for循环？任何帮助将受到高度赞赏。谢谢，马蒙

Answer 1

定义要作为函数的附加输入参数修改的参数：

function F = ODE_site(t,y,param)
%%Parameter block
k1f=param(1);
k1b=param(2); %%and so on

%%Elementary rate block
r1=k1f*y(1)-k1b*P*y(5);
and so on

%%Mass balance block
F=[  r1-r5-r78+r86 ;
    and so on ];
%% End of function

在优化参数：

之后，您可以在ode15（）中将参数移交给您的函数

optode = odeset('NonNegative',1:41,'Abstol',1E-20,'RelTol',1E-20);
y0=zeros(41,1);
y0(41) = 1;
para=[1e5, 1e8]
[t,y]=ode15s(@ODE_site,[0,50000000000],y0,optode,para);

两个注释：

*）代码未经测试。由于你的例子不是可执行的，我也不想做一个正在运行的例子。

*）看起来你正在解决化学反应动力学问题。您最有可能通过使用矩阵和向量运算来进一步优化代码。因此，您可以将其存储在一个向量r1, r2, r3,中，而不是使用单独的变量r(1), r(2), r(3), ... 你的最后一行，可能是反应载体与化学计量矩阵的乘积。

matlab for ode求解器中的循环

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