如何评估随机森林分类器的性能?

时间:2015-03-19 15:14:54

标签: python machine-learning scikit-learn random-forest

我最近开始使用scikit learn sklearn.ensemble.RandomForestClassifier在Python中使用随机林实现。我在Kaggle上找到了一个示例脚本,用于使用随机森林(见下文)对Landcover进行分类,我试图用它来磨练我的技能。我有兴趣评估随机森林分类的​​结果。

例如,如果我要使用R中的randomForest执行分析,我会使用varImpPlot()包中的randomForest评估变量重要性:

require(randomForests)
...
myrf = randomForests(predictors, response)
varImpPlot(myrf)

为了了解错误率的现成估计和分类的误差矩阵,我只需输入' myrf'进入口译员。

如何使用Python以编程方式评估这些错误指标?

请注意,我知道文档中有几个可能有用的属性(例如feature_importances_oob_score_oob_decision_function_),但我不确定如何实际应用这些


RF脚本示例

import pandas as pd
from sklearn import ensemble

if __name__ == "__main__":
  loc_train = "kaggle_forest\\train.csv"
  loc_test = "kaggle_forest\\test.csv"
  loc_submission = "kaggle_forest\\kaggle.forest.submission.csv"

  df_train = pd.read_csv(loc_train)
  df_test = pd.read_csv(loc_test)

  feature_cols = [col for col in df_train.columns if col not in ['Cover_Type','Id']]

  X_train = df_train[feature_cols]
  X_test = df_test[feature_cols]
  y = df_train['Cover_Type']
  test_ids = df_test['Id']

  clf = ensemble.RandomForestClassifier(n_estimators = 500, n_jobs = -1)

  clf.fit(X_train, y)

  with open(loc_submission, "wb") as outfile:
    outfile.write("Id,Cover_Type\n")
    for e, val in enumerate(list(clf.predict(X_test))):
      outfile.write("%s,%s\n"%(test_ids[e],val))

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

培训结束后,如果您有测试数据和标签,您可以通过以下方式检查准确性并生成ROC图/ AUC分数:

from sklearn.metrics import classification_report
from sklearn.metrics import roc_curve, auc
import matplotlib.pyplot as plt

# overall accuracy
acc = clf.score(X_test,Y_test)

# get roc/auc info
Y_score = clf.predict_proba(X_test)[:,1]
fpr = dict()
tpr = dict()
fpr, tpr, _ = roc_curve(Y_test, Y_score)

roc_auc = dict()
roc_auc = auc(fpr, tpr)

# make the plot
plt.figure(figsize=(10,10))
plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--')
plt.xlim([-0.05, 1.0])
plt.ylim([0.0, 1.05])
plt.xlabel('False Positive Rate')
plt.ylabel('True Positive Rate')
plt.grid(True)
plt.plot(fpr, tpr, label='AUC = {0}'.format(roc_auc))        
plt.legend(loc="lower right", shadow=True, fancybox =True) 
plt.show()

答案 1 :(得分:0)

您可以使用的一些基本指标是准确性,f1得分和接收器工作特性曲线下的面积,这些都可以在sklearn库中找到。

您可以在sklearn库here中找到可用的指标。​​