我最近开始使用scikit learn sklearn.ensemble.RandomForestClassifier在Python中使用随机林实现。我在Kaggle上找到了一个示例脚本,用于使用随机森林(见下文)对Landcover进行分类,我试图用它来磨练我的技能。我有兴趣评估随机森林分类的结果。
例如,如果我要使用R中的randomForest
执行分析,我会使用varImpPlot()
包中的randomForest
评估变量重要性:
require(randomForests)
...
myrf = randomForests(predictors, response)
varImpPlot(myrf)
为了了解错误率的现成估计和分类的误差矩阵,我只需输入' myrf'进入口译员。
如何使用Python以编程方式评估这些错误指标?
请注意,我知道文档中有几个可能有用的属性(例如feature_importances_
,oob_score_
和oob_decision_function_
),但我不确定如何实际应用这些
RF脚本示例
import pandas as pd
from sklearn import ensemble
if __name__ == "__main__":
loc_train = "kaggle_forest\\train.csv"
loc_test = "kaggle_forest\\test.csv"
loc_submission = "kaggle_forest\\kaggle.forest.submission.csv"
df_train = pd.read_csv(loc_train)
df_test = pd.read_csv(loc_test)
feature_cols = [col for col in df_train.columns if col not in ['Cover_Type','Id']]
X_train = df_train[feature_cols]
X_test = df_test[feature_cols]
y = df_train['Cover_Type']
test_ids = df_test['Id']
clf = ensemble.RandomForestClassifier(n_estimators = 500, n_jobs = -1)
clf.fit(X_train, y)
with open(loc_submission, "wb") as outfile:
outfile.write("Id,Cover_Type\n")
for e, val in enumerate(list(clf.predict(X_test))):
outfile.write("%s,%s\n"%(test_ids[e],val))
答案 0 :(得分:1)
培训结束后,如果您有测试数据和标签,您可以通过以下方式检查准确性并生成ROC图/ AUC分数:
from sklearn.metrics import classification_report
from sklearn.metrics import roc_curve, auc
import matplotlib.pyplot as plt
# overall accuracy
acc = clf.score(X_test,Y_test)
# get roc/auc info
Y_score = clf.predict_proba(X_test)[:,1]
fpr = dict()
tpr = dict()
fpr, tpr, _ = roc_curve(Y_test, Y_score)
roc_auc = dict()
roc_auc = auc(fpr, tpr)
# make the plot
plt.figure(figsize=(10,10))
plt.plot([0, 1], [0, 1], 'k--')
plt.xlim([-0.05, 1.0])
plt.ylim([0.0, 1.05])
plt.xlabel('False Positive Rate')
plt.ylabel('True Positive Rate')
plt.grid(True)
plt.plot(fpr, tpr, label='AUC = {0}'.format(roc_auc))
plt.legend(loc="lower right", shadow=True, fancybox =True)
plt.show()
答案 1 :(得分:0)
您可以使用的一些基本指标是准确性,f1得分和接收器工作特性曲线下的面积,这些都可以在sklearn库中找到。
您可以在sklearn库here中找到可用的指标。