情节材料结构 - Pymatgen

时间：2014-12-27 04:41:12

标签： python plot vtk

有没有人使用过pymatgen？ 当我访问official site of pymatgen时。我看到了快速入门教程。我觉得这个包非常好。我的问题是我想在这个图中绘制材料结构。 enter image description here

我从该网站获得了一些信息，用于绘制结构

#Visualize a structure. Requires VTK to be installed.

pmg view filename

我已经下载了VTK。但我不知道，如何使用它。我无法理解清楚。

2 个答案:

答案 0 :(得分：0)

请使用python支持安装vtk，具体取决于计算机上的python版本。

对于python 3 

conda install -c clinicalgraphics vtk

对于python 2 

conda install -c anaconda vtk

答案 1 :(得分：0)

我和我的同事们经常使用pymatgen，但是我们添加了一个外部程序包来显示名为nglview的jupyter笔记本中的pymatgen结构。

conda install -c conda-forge nglview

显示structure_to_show（pymatgen结构对象）：

    import nglview as nv

    view = nv.show_pymatgen(structure_to_show)
    view.add_unitcell()
    view

这可以非常快地处理非常大的结构

相关问题
最新问题