我是多变量统计数据的新手，所以如果这个问题天真，或者我错过了重要的事情，请原谅我。
我想知道在使用adonis时如何处理不平衡的设计。我有一个存在于河流沉积物中的微生物群落的数据集和因子流（4个水平），US_DS（2个水平）和季节（2个水平）（我还有其他因素，但暂时坚持这些因素）。例如代码如下：
dist.L2<-vegdist(L2, mehod=”bray”)
adonis(dist.L2~Season*Stream*US_DS, data=factors, permutations=199)
不幸的是，设计是不平衡的（有些网站只有1个重复，而其他网站最多有3个）。
我尝试过运行adonis，但是因为anodis使用了类型1 SS，我将这些因素放入的顺序产生了很大的差异，并且没有理由将一个因素放在其他因素之前。我知道其他统计数据包通过使用II型或III型平方和来解决这个问题，无论您使用何种类型的SS，都有优点和缺点。我的数据的性质意味着其他更简单的统计数据测试并不合适。
我想知道如何使用adonis的III类错误，或者是否有一个程序要使用I型错误和adonis，因为它是找到一个合适的测试。感谢
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您可能需要通过更改两个因素的顺序来执行Adonis两次。
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