尝试在本地运行爆炸时出错

时间:2014-11-04 10:35:18

标签: bioinformatics fasta blast

我正在尝试使用多个fasta文件作为查询在本地运行blastp,使用此命令

Siddharths-MacBook-Air:~ Siddharth$ blastp -db nr -query trans_mod3.txt  out results.out -remote

我一直在遇到这个错误消息:

Critical: (110.6) CNcbiRegistry: Syntax error in system-wide configuration file: NCBI C++ Exception:
  /Users/coremake/release_build/build/PrepareRelease_IntelMAC_JSID_01_62_130.14.18.6_9056__PrepareRelease_IntelMAC_1386704300/c++/compilers/unix/../../src/corelib/ncbireg.cpp", line 630: Error: ncbi::IRWRegistry::x_Read() - Invalid registry entry format: 'users/Siddharth/blast' (m_Pos = 2)

Command line argument error: Argument "query". File is not accessible:  `trans_mod3.txt'

我无法弄清楚我做错了什么。查询文件格式正确,我确定,因为我可以将它用作ncbi blast页面的输入。输入文件是包含大约200个序列的多个fasta文件。

0 个答案:

没有答案