为needleman wunsch算法实现NWalign.java对齐脚本

Question

我正在尝试运行找到here的 NWaling.java 文件。我提到的链接上的代码使用了jaligner库。我从here下载了这个Java包。在zip文件夹中有一个JAR文件。我正在使用eclipse开发代码。每当我将这个JAR文件添加到代码中时，都会丢失一些类，例如：

import jaligner.NeedlemanWunschGotoh;

＆安培;

import jaligner.matrix.MatrixGenerator;

同样在整个压缩文件夹中没有任何pom.xml文件允许我将整个文件夹作为maven项目导入到eclipse中。有人可能会建议我如何导入这个jaligner库并在eclipse中使用它？感谢。

Answer 1

您可以从here下载 jaligner 算法的社区实现。

查看this project来源，您可能会找到所有搜索过的文物。

Answer 2

可以找到NWalign.java的完整Eclipse项目here，包括.classpath文件，其中列出了所有依赖项。