如何计算矩阵的梯度以在R中绘制矢量场?

时间:2014-09-06 21:01:59

标签: r

我环顾四周,但我能找到的是如何使用diff(d)找到矩阵的导数,其中d是一个矩阵。这不会给我矢量,只是一堆标量。我不确定如何处理这些。

我想找到一种方法来计算整个表面中由矩阵表示的几个点处的梯度。该梯度可以显示为矢量场。关于在R中创建矢量字段有question here,但我不知道如何计算渐变。

编辑:我将尝试详细说明我正在寻找的东西。假设我有一个这样的矩阵:

     X0 X1.5 X3.1 X4.3 X5.9 X7.3 X8.6 X9.8  X11 X12.3 X13.6 X14.9 X16.4 X17.9 X20
 [1,]  0  1.4  3.0  4.5  6.0  7.3  8.6  9.7 10.9  12.2  13.4  14.9  16.4  18.1  20
 [2,]  0  1.6  3.2  4.9  6.4  7.6  8.7  9.6 10.6  11.8  13.2  14.7  16.4  18.1  20
 [3,]  0  1.7  3.5  5.2  7.0  8.3  9.0  9.4  9.9  11.1  12.7  14.6  16.3  18.2  20
 [4,]  0  1.8  3.7  5.8  8.0  9.3  9.3  9.3  9.4  10.2  12.1  14.1  16.2  18.0  20
 [5,]  0  1.7  3.9  6.0  8.8  9.3  9.3  9.4  9.6   9.9  11.8  14.0  16.2  18.1  20
 [6,]  0  1.8  3.8  5.7  8.1  9.3  9.3  9.4  9.6  10.1  12.3  14.4  16.3  18.0  20
 [7,]  0  1.6  3.5  5.2  7.0  8.4  9.1  9.5 10.1  11.3  13.0  14.6  16.4  18.2  20
 [8,]  0  1.5  3.2  4.9  6.4  7.7  8.7  9.7 10.7  11.9  13.3  14.9  16.5  18.3  20
 [9,]  0  1.5  3.1  4.6  6.0  7.4  8.6  9.7 10.9  12.1  13.5  15.1  16.6  18.3  20
[10,]  0  1.5  3.0  4.6  6.0  7.3  8.5  9.7 10.9  12.4  13.6  13.1  16.6  18.2  20

绘制它时看起来像这样:

3D Surface of the above matrix

现在,我想要的只是这样:在x和y的某些间隔,我希望能够找到表面的斜率。因此,例如,从x = 0,y = 0开始,我想找到我可以用于稍后绘制的矢量形式的斜率。然后,找到x = 0,y = 1处的斜率,依此类推y的所有值。然后找到y的所有值,x = 1,依此类推。

这样做的目的是让一组矢量可以在矢量场like this中绘制。

这可以在R?

中完成

2 个答案:

答案 0 :(得分:10)

这是raster套餐方法。从Ben的答案开始:

m2 <- matrix(c(
0,1.4,3.0,4.5,6.0,7.3,8.6,9.7,10.9,12.2,13.4,14.9,16.4,18.1,20,
0,1.6,3.2,4.9,6.4,7.6,8.7,9.6,10.6,11.8,13.2,14.7,16.4,18.1,20,
0,1.7,3.5,5.2,7.0,8.3,9.0,9.4,9.9,11.1,12.7,14.6,16.3,18.2,20,
0,1.8,3.7,5.8,8.0,9.3,9.3,9.3,9.4,10.2,12.1,14.1,16.2,18.0,20,
0,1.7,3.9,6.0,8.8,9.3,9.3,9.4,9.6,9.9,11.8,14.0,16.2,18.1,20,
0,1.8,3.8,5.7,8.1,9.3,9.3,9.4,9.6,10.1,12.3,14.4,16.3,18.0,20,
0,1.6,3.5,5.2,7.0,8.4,9.1,9.5,10.1,11.3,13.0,14.6,16.4,18.2,20,
0,1.5,3.2,4.9,6.4,7.7,8.7,9.7,10.7,11.9,13.3,14.9,16.5,18.3,20,
0,1.5,3.1,4.6,6.0,7.4,8.6,9.7,10.9,12.1,13.5,15.1,16.6,18.3,20,
0,1.5,3.0,4.6,6.0,7.3,8.5,9.7,10.9,12.4,13.6,13.1,16.6,18.2,20),
byrow=TRUE,nrow=10)

转换为栅格(注意转置和一般摆弄是因为矩阵从左上角开始,但坐标从右下角开始):

require(raster)
require(rasterVis)
r=raster(t(m2[,ncol(m2):1]), xmn=0.5,xmx=nrow(m2)+.5, ymn=0.5,ymx=ncol(m2)+0.5)

现在Ben暗示,你需要给它一个坐标系。目前它只有1到10和1到15的数字行和列坐标。如果这是一个真实世界的地图,那么raster需要知道这是纬度,米还是英尺,以及X坐标和Y坐标是否在相同的比例上。这很重要,即使是映射到现实世界的数据,就像我怀疑你的数据一样。

如果您的X和Y坐标不是相同的单位,则渐变没有意义。如果X是以欧姆为单位的电阻,Y是以安培为单位的电流,Z是以伏特为单位的测量电位那么斜率是多少?那么,X轴上的每欧姆为2V,Y方向上为每安培-3V。那么一共呢?你不能说,因为你不能用欧姆和放大器来组合方向。

所以我假设无论X和Y的单位在你的例子中,它们都是相同的单位(也许它们是电阻器A上的欧姆和电阻器B上的欧姆)并且它们从1到1 10和1到15。

现在我认为有一个投影代码只是说&#34;这些是x和y坐标,没有真正的地理意义&#34;但我无法记住它是什么或找到它。所以我只是撒谎,并使用我知道的常规笛卡尔网格的任何旧坐标参考系统。在这种情况下,GB国家电网。如果你试图在地图上绘制这个光栅,它将是英格兰西南部海岸附近的一个小方块,因为这个网格来源的地方,你的数据在这个系统中是10米乘15米:

projection(r)=CRS("+init=epsg:27700")

让我们设定它以确保我们还没有搞砸了:

persp(r,theta=-50,phi=20, shade=0.23,col="red")

persepctive view of sample data

请注意,X和Y坐标指向与样本图相同的方向,所以我知道到目前为止我已经完成了这一点。

现在我可以levelplot rasterVis来做vectorplot(r, scaleSlope=.1) ,但我必须做一点点缩放。这是因为真实地图上的渐变是根据具有相同单位(可能是米或英尺)的高度和距离计算的,但您的数据只是数字。因此,在自然整数坐标系中,梯度实际上非常小。所以:

vectorplot

给你:

vector plot

注意斜率通常是向下的,因为这是你的X和Y轴在你的示例图中的方式(因此在我的栅格中)。另请注意,单元格是正方形的,因为我们保留了数据的纵横比(因为我们将X和Y坐标视为度量相等)。 Ben的回答显示了一般的L-R流,这意味着他的X和Y坐标不按常规顺序排列。

此外,{{1}}中的渐变搜索算法会进行一定程度的平滑处理,因此右上方的小不连续性看起来并不像Ben的差分算法那样极端:

enter image description here

但你必须决定是否真的要绘制平滑的渐变或有限的差异......

答案 1 :(得分:4)

这是一些开始的东西。

m <- matrix(1:9,nrow=3)

您必须决定是在开头还是结尾填写NA或0,或者复制diff(x)中的第一个或最后一个值,或者......

bdiff <- function(x) c(NA,diff(x))

x(行)方向的渐变:

t(apply(m,1,bdiff))
##      [,1] [,2] [,3]
## [1,]   NA    3    3
## [2,]   NA    3    3
## [3,]   NA    3    3

在y(列)方向:

apply(m,2,bdiff)
##      [,1] [,2] [,3]
## [1,]   NA   NA   NA
## [2,]    1    1    1
## [3,]    1    1    1

对于您的示例,大致相似的内容有效:

m2 <- matrix(c(
0,1.4,3.0,4.5,6.0,7.3,8.6,9.7,10.9,12.2,13.4,14.9,16.4,18.1,20,
0,1.6,3.2,4.9,6.4,7.6,8.7,9.6,10.6,11.8,13.2,14.7,16.4,18.1,20,
0,1.7,3.5,5.2,7.0,8.3,9.0,9.4,9.9,11.1,12.7,14.6,16.3,18.2,20,
0,1.8,3.7,5.8,8.0,9.3,9.3,9.3,9.4,10.2,12.1,14.1,16.2,18.0,20,
0,1.7,3.9,6.0,8.8,9.3,9.3,9.4,9.6,9.9,11.8,14.0,16.2,18.1,20,
0,1.8,3.8,5.7,8.1,9.3,9.3,9.4,9.6,10.1,12.3,14.4,16.3,18.0,20,
0,1.6,3.5,5.2,7.0,8.4,9.1,9.5,10.1,11.3,13.0,14.6,16.4,18.2,20,
0,1.5,3.2,4.9,6.4,7.7,8.7,9.7,10.7,11.9,13.3,14.9,16.5,18.3,20,
0,1.5,3.1,4.6,6.0,7.4,8.6,9.7,10.9,12.1,13.5,15.1,16.6,18.3,20,
0,1.5,3.0,4.6,6.0,7.3,8.5,9.7,10.9,12.4,13.6,13.1,16.6,18.2,20),
byrow=TRUE,nrow=10)

rr <- row(m2)
cc <- col(m2)
dx <- t(apply(m2,1,bdiff))
dy <- apply(m2,2,bdiff)
sc <- 0.25
off <- -0.5 ## I *think* this is right since we NA'd row=col=1
plot(rr,cc,col="gray",pch=16)
arrows(rr+off,cc+off,rr+off+sc*dx,cc+off+sc*dy,length=0.05)