我正在使用scikit-image加载TIF文件并在ipython笔记本(2.2.0版)中内联显示。然而,这是有效的,首次显示时图像非常小,当我使用图像右下角的可拖动手柄调整图像时,它只是重新调整图像,同时保留原始图像的分辨率,因此它是放大时非常模糊。它基本上就像ipython正在将我的图像转换为动态缩略图一样。
我也尝试过使用matplotlib的plt.imshow()
,结果完全相同。我用ipython notebook --pylab inline
启动笔记本。
from skimage import io
import matplotlib.pyplot as plt
image_stack = io.MultiImage("my_image.tif")
image = image_stack[0] # it's a multi-page TIF, this gets the first image in the stack
io.imshow(image) # or plt.imshow(image)
io.show() # or plt.show()
答案 0 :(得分:25)
要在笔记本上更改“%matplotlib inline”数字分辨率,请执行以下操作:
import matplotlib as mpl
mpl.rcParams['figure.dpi']= dpi
如果你要去笔记本download/print,我建议将dpi设置在150到300之间。确保%matplotlib inline
在mpl.rcParams['figure.dpi']= dpi
之前运行,否则magic命令会将dpi重置为其默认值(@fabioedoardoluigialberto会注意到这一点)。
下面的snipppet只更改通过savefig方法保存的数字的dpi,而不是内联生成的数字。
import matplotlib as mpl
mpl.rc("savefig", dpi=dpi)
答案 1 :(得分:13)
根据https://www.reddit.com/r/IPython/comments/1kg9e2/ipython_tip_for_getting_better_quality_inline/
您也可以在单元格中执行此魔法:
%config InlineBackend.figure_format = 'svg'
打印质量看起来会更好。您也可以将svg
更改为retina
,以使用更高分辨率的PNG(不太好)。不过请注意,如果您的图片过于复杂,svg
图片的尺寸会比retina
图片的尺寸大得多
答案 2 :(得分:7)
内联matplotlib数字的分辨率与您在GUI窗口或保存的图像中看到的相比有所缩小,可能是为了节省笔记本文件中的空间。要更改它,您可以执行以下操作:
import matplotlib as mpl
mpl.rc("savefig", dpi=dpi)
其中dpi
是一些控制内联图的大小/分辨率的数字。我相信内联默认值是80,matplotlib的默认值是100。
通过拖动手柄来缩放生成的绘图的原因并不起作用,即绘图呈现为png,因此缩放它会缩放但不会更改内在分辨率。
答案 3 :(得分:2)
假设这与使用iPython笔记本(使用%matplotlib内联)进行拖动和调整图像大小相同,修复相当简单。
如果您只是创建具有不同默认大小的图形,则分辨率也会随着默认大小(Change resolution of imshow in ipython)而增加。例如:
fig = plt.figure(figsize = (10,10))
ax = fig.add_subplot(111)
ax.imshow(array)
这样的事情会增加你想要绘制的东西的分辨率。这似乎对我的代码有用:
from skimage import io
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
image_stack = io.MultiImage("my_image.tif")
image = image_stack[0]
fig = plt.figure(figsize= (20,20)) #create an empty figure to plot into with 20x20 size
io.imshow(image)
io.show()