当我在reshape2包中的dcast函数中使用min或max时,我收到以下警告。它告诉我什么?我找不到任何可以解释警告信息的内容,而且当我使用max而不是当我使用mean或其他聚合函数时,我对它的原因感到有点困惑。
警告信息:
在.fun(.value [0],...)中:min没有非缺失参数;返回Inf
这是一个可重复的例子:
data(iris)
library(reshape2)
molten.iris <- melt(iris,id.var="Species")
summary(molten.iris)
str(molten.iris)
#------------------------------------------------------------
# Both return warning:
dcast(data=molten.iris,Species~variable,value.var="value",fun.aggregate=min)
dcast(data=molten.iris,Species~variable,value.var="value",fun.aggregate=max)
# Length looks fine though
dcast(data=molten.iris,Species~variable,value.var="value",fun.aggregate=length)
#------------------------------------------------------------
# No warning messages here:
aggregate(value ~ Species + variable, FUN=min, data=molten.iris)
aggregate(value ~ Species + variable, FUN=max, data=molten.iris)
#------------------------------------------------------------
# Or here:
library(plyr)
ddply(molten.iris,c("Species","variable"),function(df){
data.frame(
"min"=min(df$value),
"max"=max(df$value)
)
})
#------------------------------------------------------------
答案 0 :(得分:38)
您收到此警告,因为min / max应用于长度为0的参数的数字。
这会再现警告。
min(numeric(0))
[1] Inf
Warning message:
In min(numeric(0)) : no non-missing arguments to min; returning Inf
请注意,对于mean
,您不会收到警告:
mean(numeric(0))
[1] NaN
这只是一个警告,对计算没有任何影响。您可以使用suppressWarnings
suppressWarnings(dcast(data=molten.iris,
Species~variable,value.var="value",
fun.aggregate=min))
上面我只是回答这个问题:警告的含义是什么?为什么我们有这个最小/最大而不是平均功能。问题为dcast
将聚合函数应用于长度为0的向量的问题,它只是一个BUG,您应该联系包维护者。我认为错误来自plyr::vaggregate
内部使用的dcast
函数,
plyr::vaggregate(1:3,1:3,min)
Error in .fun(.value[0], ...) :
(converted from warning) no non-missing arguments to min; returning Inf
特别是这行代码:
plyr::vaggregate
function (.value, .group, .fun, ..., .default = NULL, .n = nlevels(.group))
{
### some lines
....
### Here I don't understand the meaning of .value[0]
### since vector in R starts from 1 not zeros!!!
if (is.null(.default)) {
.default <- .fun(.value[0], ...)
}
## the rest of the function
.....
}