knitr：当我在chunk中进行小的更改时保持缓存

Question

我可以理解地在更新块时破坏了缓存（但结果应该是相同的，这是整容变化）。但是，我不想再次运行这个块，因为它需要1周才能运行。如何更改缓存以便新代码认为缓存保持不变？

我想我只需要更改缓存文件夹中的文件名。但是我不知道如何在不运行代码的情况下更改它们，因为knitr只在成功完成块后才写入文件。

另一个动机是使用不同的knitr版本时knitr缓存可能无效。这发生在1.5和1.5.33之间，即开发版本。另见：R knitr: is it possible to use cached results across different machines?。我想如果我找到上述解决方案可以帮助解决这个问题。

Answer 1

使用knitr缓存来存储为期一周的模拟结果听起来有点 crazy 易受灾难影响。

我对更安全的工作流程的建议是：

1. 运行模拟并将结果存储在一个文件中（csv，rda，任何合适的文件）。

2. 在echo = FALSE报告的开头附近将数据加载到一个块（可能是knitr）。

现在模拟和报告已经解耦。