命令dist（x，method =“binary”）如何计算距离矩阵？

Question

我一直试图解决这个问题，但没有取得多大成功。我正在使用具有二进制数据（0和1）的表。我设法使用 R 函数dist(x,method="binary")从我的数据估计距离矩阵，但我不太确定这个函数究竟是如何估计距离矩阵的。是否使用Jaccard系数J =（M11）/（M10 + M01 + M11）？

Answer 1

这可以在帮助页?dist中找到：

  

此函数计算并返回通过使用指定的距离度量计算的距离矩阵，以计算数据矩阵行之间的距离。

     

[...]

     

二进制:(又名非对称二进制）：向量被视为二进制   比特，所以非零元素是'开'，零元素'关'。该   距离是其中只有一个位的比特的比例   那些至少有一个人在上的人。

这相当于Jaccard distance as described in Wikipedia：

  

Jaccard距离的另一种解释是对称差异与联合的大小之比。

在你的符号中，它是1 - J =（M01 + M10）/（M01 + M10 + M11）。