猿phylo对象igraph问题

Question

ape库中有一个函数可以将ape phylo obj转换为igraph网络或网络对象（来自R库网络）。

as.igraph(cur_Tree)

或

as.network(cur_Tree)

我与前者有问题：

as.igraph(cur_Tree, directed = FALSE)

Error in graph(unname(ids[t(el)]), directed = directed) : 
At type_indexededgelist.c:117 : cannot create empty graph with negative number of vertices, Invalid value

发生了什么？提前谢谢。

Answer 1

使用as.igraph（）将此树转换为igraph将需要以下hack：

x$node.label[1] <- " "

这是因为node.label的第一个条目（或任何地方）是== ""