在骨架化后找到纤维之间的交叉点

Question

在 Matlab 中，我重建了一个含有多种纤维的3D胶原网。结果我发现了所有纤维。我可以绘制每个光纤，它看起来像原始输入图像的镂空版本。我现在的目标是找到这些纤维之间的交叉点。 （图像的一小部分如下所示，以及我在Matlab中进行的重建）

我一直在思考应该遵循哪些步骤来实现这一目标，但是，我想有一种更容易和更优化的方式。这些是我提出的主要步骤：

- 计算所有纤维的厚度。这可以通过检查相同光纤的几个点与最近背景点（像素值= 0的点）之间的距离来完成。然后从所有距离中取出平均值，并将其作为该光纤的最终厚度值。

- 下。一旦我们知道了所有光纤的厚度，尝试通过将所有放置在距离相等（加上阈值）的点到光纤化纤维的每个点来计算每根光纤的表面。 / p>

- 最后。一旦我获得了每根光纤的外部网格点（＆＃34;皮肤点＆＃34;），计算所有光纤网格之间的交点/点。

我从未在Matlab中使用网格，所以我不确定是否使用它们是为了这个目的。我甚至不知道它是否可能。提前感谢您的帮助。

原始图像（ImajeJ重建）

使用我的代码后我得到了什么（镂空版本）

Answer 1

假设您将每个点表示为（x，y，z，val），其中x，y和z是空间坐标，val是一个位域，表示特定点所属的光纤。最初，所有点的val都是0。如果某些（x1，y1，z1）属于光纤-1，则设置val的LSB，使得该点为（x1，y1，z1，0x01）：val为十六进制。如果某些（x2，y2，z2）属于光纤-2，那么（x2，y2，z2,0x02），同样根据它所属的光纤设置val的特定位。当你对所有点执行此操作时，它们的val字段将指示它们属于哪些光纤。因此，在val字段中设置了超过1位的所有点将为您提供相交的光纤。