Question

我尝试使用ChemoSpec files2SpectraObect命令加载NIR光谱。数据直接来自* csv文件，但我收到以下错误消息：

files2SpectraObject（gr.crit = c（＆＃34; BP＆＃34;，＆＃34; TP＆＃34;）， + gr.cols = c（＆＃34; red3＆＃34;，＆＃34; dodgerblue4＆＃34;）， + freq.unit =＆＃34;波长＆＃34;， + int.unit =＆＃34;反射＆＃34;， + descrip =＆＃34; Avenue samples＆＃34;， + format =＆＃34; csv＆＃34;， + out.file =＆＃34; NIR.ave＆＃34;）

Converting integer frequency values to numeric
*** There seem to be one or more problems with these spectra!
Error in chkSpectra(spectra) : 
  Sorry, we can't continue this way: It's not me, it's you!
In addition: Warning message:
In chkSpectra(spectra) : The frequency data appear to be corrupt

setwd（＆＃34; W：\ SciFac \ OrgGeochem \ Staff \ Darren Beriro \ PhD \ R_PhD \ MIR光谱文件＆＃34;） files2SpectraObject（gr.crit = c（＆＃34; bp＆＃34;，＆＃34; tp＆＃34;）， + gr.cols = c（＆＃34; red3＆＃34;，＆＃34; dodgerblue4＆＃34;）， + freq.unit =＆＃34; Wavelenth＆＃34;， + int.unit =＆＃34;反射＆＃34;， + descrip =＆＃34; Avenue samples＆＃34;， + format =＆＃34; csv＆＃34;， + out.file =＆＃34; MIR.ave＆＃34;）

我检查了用于创建csv文件的数据帧，而波数是一个数值变量。数据范围从整数到350到2500。我以相同的方式加载了FTIR / MIR数据 - 频率值包括小数位，这些文件加载得很好。

Answer 1

好的，我只是逐行浏览files2SpectraObject和chkSpectra中的代码，chkSpectra是第一个函数内部调用的函数。我看到有两个问题。

如果频率是整数，chkSpectra将发出警告并停止该函数。我认为您无法在数据中修复此问题。这是粗略的，但我建议这个修复。

修复（chkSpectra）

删除运行stop（）

的第81行

fix（files2SpectraObject）

在第171行，使用相同的参数将saveObject（）更改为save（）。这似乎是一个错误或功能，而不是我没有的常见包。

使用fix只会临时修复这些功能，所以除非你保存工作区，否则你每次加载csv时都需要重新运行这个修复程序

Answer 2

检查分隔符和小数符号。尝试使用“，”作为十进制和“;”的csv2分离器。

使用files2SpectraObect的R ChemoSpec错误：频率数据似乎已损坏

2 个答案: