在ChemoSpec中将SpectraObjects导出为csv

Question

我正在使用ChemoSpec来分析R中的FTIR光谱。

我能够使用files2SpectraObject导入几个csv文件，应用了一些数据预处理程序，例如规范化和分级，并生成带有结果的新SpectraObjects。

是否可以从生成的SpectraObjects中将数据导出回csv格式？

到目前为止，我试过这个

write.table(ftirbin, "E:/ftirbin.txt", sep="\t")

得到了这个：

Error in as.data.frame.default(x[[i]], optional = TRUE, stringsAsFactors = stringsAsFactors) : 
  cannot coerce class ""Spectra"" to a data.frame

提前致谢！

Answer 1

如果您查看Spectra，您将看到your_object$data对象的存储方式。强度值位于your_object$freq，频率值位于SrE.IR。因此，您无法导出整个对象（它不是数据框，而是列表），但您可以导出碎片。要导出第一列中的频率以及以下列中的样本，您可以执行此操作（示例使用内置数据集tmp <- cbind(SrE.IR$freq, t(SrE.IR$data)) colnames(tmp) <- c("freq", SrE.IR$names) tmp <- as.data.frame(tmp) # it was a matrix ）：

write.csv

然后你可以用write.table或git rebase --interactive <commit-id> 写出来（检查参数以避免行号）。