Question

以下R命令将安装所有CRAN包：

availablePackages <- available.packages()[,1]
install.packages(availablePackages)

以下命令将列出所有已安装的软件包：

installedPackages <- .packages(all.available = TRUE)

我的问题是：如何指示R安装尚未安装的所有CRAN软件包？

Answer 1

坦率地说，我认为这是艰苦的工作......它会持续数天，甚至数周（取决于资源），但这是代码（我只是喜欢做些琐事）：

# get names of installed packages
packs <- installed.packages()
exc <- names(packs[,'Package'])

# get available package names
av <- names(available.packages()[,1])

# create loooong string
ins <- av[!av %in% exc]
install.packages(ins)

我仍然不明白你为什么要这样做，但是，嘿......有些事情本来就不应该...... 最让我感到惊讶的是你已经回答了自己的问题！你得到了你需要的东西，这取决于你把事情放在一起...... 我们错过了这一点吗？你还有别的想法吗？！？

Answer 2

1）你为什么要那样做？他们有超过3500 （截至2012年2月）？

2）您是否看过CRAN Task Views和允许您从给定任务安装软件包的ctv软件包？

3）你粗体问题是一个简单的索引查询，你可以手工完成（除此之外，还要看help(sets)）

R> available <- LETTERS                  # a simple set
R> installed <- LETTERS[c(1:10, 15:26)]  # a simple subset
R> available[ ! available %in% installed ]
[1] "K" "L" "M" "N"
R>

编辑：以回应您的后续行动：

a）如果软件包在Linux和Windows上未通过“R CMD check”，则不会上传到CRAN。这样就完成了工作。

b）获得所有取决于你最终的工作也是如你所见。我们为cran2deb做了这个问题，它位于http://debian.cran.r-project.org（这是完整的Debian软件包构建，不仅仅是安装）。在2150个包中，我们得到了大约2050个。有一些我们拒绝构建，因为许可证，一些我们不能因为缺少标头或库而我们无法构建，因为他们需要例如BioConductor包。

Answer 3

输入此命令，然后将自动安装所有包：

install.packages(available.packages()[,1])

Answer 4

我已经对此进行了测试并且可以正常运行

availablePackages=available.packages()
availablePackages<-as.vector(availablePackages[,1])
installedPackages=.packages(all.available = TRUE)
missedPackages<-setdiff(availablePackages, installedPackages)
for (i in 1:length(missedPackages))
{
pkgName <- missedPackages[i]
install.packages(pkgName)
}
print("END")

此致

Answer 5

更好地使用：

    check.and.install.Package("pkgName")

调用该函数并检查是否已安装所需的软件包：

{{1}}

Answer 6

根据我的经验，一次安装所有R软件包是不明智的！即使您不（使用库函数）调用所有这些程序包，仅通过坐在主目录中，它们也会降低R studio的速度。至少这就是我的情况。

安装尚未安装的所有CRAN包？

6 个答案: