出于某种原因,我突然无法在R中安装软件包(我随后更新到最新版本的R并运行Windows 7)。例如,如果我输入:
install.packages('beeswarm')
将软件包安装到'D:/ Rlibs'中(未指定'lib') ---请选择一个CRAN镜像用于本次会议---尝试URL“http://www.stats.bris.ac.uk/R/bin/windows/contrib/3.0/beeswarm_0.1.5.zip” 内容类型'text / html'长度未知打开的URL已下载1859 字节
read.dcf(file.path(pkgname,“DESCRIPTION”),c(“Package”, “类型”)):无法打开连接另外:警告 消息:1:解压缩(zipname,exdir = dest):提取错误1 来自zip文件2:在read.dcf(file.path(pkgname,“DESCRIPTION”)中, c(“Package”,“Type”)):无法打开压缩文件 'beeswarm / DESCRIPTION',可能的原因'没有这样的文件或目录'
我已经读过在Windows 7中对写入某些文件夹等的权限可能存在重要限制。所以我已经花了一些时间在我的计算机的非默认区域安装R和库文件夹,并允许我自己对某些文件夹的权利,但无济于事。当我输入时可能也很重要:
.libPaths()
# [1] "D:/Rlibs"
# [2] "C:/Users/L.Halsey/Documents/R/win-library/3.0"
# [3] "C:/Users/L.Halsey/Documents/Documents/R-3.0.1/library"
我创建了几个文件夹,试图创建一个我可以成功安装库并将其设置为R使用“开始”按钮中的“环境变量”进行识别的文件夹。我不知道如何删除它们中的任何一个 - 不确定这是否与我现在因某些原因无法安装/更新软件包的整体问题相关。
答案 0 :(得分:10)
报告的错误无法打开连接。在Windows中often a firewall problem and is in the Windows R FAQ。通常的第一次尝试应该是运行internet2.dll。在控制台会话中,您可以使用:
setInternet2(TRUE)
(你认为这不是由于你的库设置是正确的。错误没有说明权限。)我不认为只是输入.libPaths
应该返回那个字符向量,因为在我的机器上我需要输入.libPaths()
来查看类似的内容。如果要减少库的位数,可以使用.libPaths
功能设置值。这将选择现有路径的第二和第三个
.libPaths( .libPaths()[2:3] )
内部调用检索路径向量,外部调用将其设置为减少的向量。
答案 1 :(得分:3)
我可能会在stackoverflow上复制很多其他答案,但是我得到与OP完全相同的错误,即:
Warning messages: 1: In unzip(zipname, exdir = dest) : error 1 in extracting from zip file 2: In read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : cannot open compressed file 'zoo/DESCRIPTION', probable reason 'No such file or directory'
原来,虽然我作为用户有权在某个目录中写入,但R没有。为了确保您没有类似的东西,请执行以下操作:
从R控制台安装调用R命令install.package
的软件包,并将所有相关目录设置为指向您的USB驱动器:
(这里我以包动物园为例)
install.packages("E:/source/zoo_1.7-12.zip",
destdir = 'E:/source', # no "/" after the path
lib = 'E:/libs',
repos = NULL)
从安装目录的目录中加载包:
library('zoo', lib.loc = 'E:/libs')
在您确定之后,它会以这种方式在您的USB驱动器上运行,您可以开始解析目录权限,并通过更改上面代码中的路径来尝试。
<强>更新强> 在某些Windows环境中,甚至您的usb-stick也可能受到R的读写保护。请确保使用您正在使用的计算机检查权限。
答案 2 :(得分:3)
以管理员身份运行RStudio为我修复了它!
答案 3 :(得分:1)
以下对我有用(基于上面的答案)
install.packages("clustvarsel", lib = "C:/Users/dnentchev/My Programs/R-3.2.2/library")
答案 4 :(得分:-2)
我遇到了同样的问题。我关闭了 Windows 防火墙,并以管理员身份运行 RStudio。因此,该错误已修复。