Rcpp新手我正在测试如何从R中检索和使用具有已知结构的嵌套列表,而无需再次复制部分列表。小代码示例(带有嵌入式R代码)似乎可以工作(cout用于调试)。
从R检索到的列表rL可能非常大,所以我不想重新分配内存(复制rL的部分)。当前代码是否复制了rL的部分?
最佳拉斯
#include <Rcpp.h>
#include <iostream>
using namespace Rcpp;
using namespace std;
// [[Rcpp::export]]
SEXP testing(const List rL) {
List L(rL);
SEXP sL2(L["L2"]);
List L2(sL2);
SEXP sStateGrpL2(L2["stateGroups"]);
List stateGrpL2(sStateGrpL2);
SEXP sStateAllocL2(L2["stateAlloc"]);
CharacterVector stateAllocL2(sStateAllocL2);
SEXP sActionGrpL2(L2["actionGroups"]);
List actionGrpL2(sActionGrpL2);
SEXP sActionAllocL2(L2["actionAlloc"]);
List actionAllocL2(sActionAllocL2);
vector<string> stateLabels;
vector<string> actionLabels;
CharacterVector actionNames;
for(int n2 = 0; n2< as<int>(L2["stages"]); n2++) {
stateLabels = as< vector<string> >(stateGrpL2[as<string>(stateAllocL2[n2])]);
int s2Size = stateLabels.size();
SEXP sAllocA(actionAllocL2[n2]);
List allocA(sAllocA);
actionNames = as<CharacterVector>(allocA[0]);
cout << "stage:" << n2 << " sN:" << as<string>(stateAllocL2[n2]) << "\n";
for (int s2=0; s2<s2Size; ++s2) {
cout << " s:" << stateLabels[s2] << " aN:" << actionNames[s2] << "\n";
actionLabels = as< vector<string> >(actionGrpL2[ as<string>(actionNames[s2]) ]);
int a2Size = actionLabels.size();
for (int a2=0; a2<a2Size; ++a2) {
cout << " a:" << actionLabels[a2] << "\n";
}
}
}
return wrap(0);
}
/*** R
L <- list( L2=list(stages=2,
stateGroups=list(s1Grp=c("a","b","c"),s2Grp=c("d","e")),
stateAlloc = c(rep("s1Grp",1),rep("s2Grp",1)),
actionGroups = list(a1Grp=c("terminate","keep"), a2Grp=c("finish")),
actionAlloc = list(list( rep("a1Grp",3) ),
list( c("a1Grp","a2Grp") )
)
)
)
testing(L)
*/
答案 0 :(得分:3)
你写道:
列表rL可能非常大,所以我不想使用新内存(复制 部分rL)。这是这样做的吗?
相当多(据我所知,从您的代码中可以看出)。
与R的所有交换使用SEXP
类型,其中P
代表指针 - 这些是浅层代理对象,不会被复制。它使用/重用R对象内存。
因此,如果您对profile / memory-profile进行了分析,那么它应该在N = 10和N = 1e5时表现相似。但证据就在布丁......
答案 1 :(得分:1)
一些事情:
循环测试n2< as<int>(L2["stages"])
难以阅读和
在每次迭代时计算效率低下。你应该
肯定只做一次。
您的所有as< vector<string> >
都创建了深层副本,而不是
利用R的字符串缓存。你不能用
而是CharacterVector
?