Rcpp中列表的索引元素

时间:2013-07-31 14:39:50

标签: r rcpp

假设我在Rcpp中有一个List,这里称为包含矩阵的x。我可以使用x[0]或其他东西提取其中一个元素。但是,如何提取该矩阵的特定元素?我的第一个想法是x[0](0,0),但这似乎不起作用。我尝试使用*符号,但也无效。

下面是一些打印矩阵的示例代码(可以很容易地提取矩阵):

library("Rcpp")

cppFunction(
includes = ' 
NumericMatrix RandMat(int nrow, int ncol)
 {
  int N = nrow * ncol;
  NumericMatrix Res(nrow,ncol);
  NumericVector Rands  = runif(N);
   for (int i = 0; i < N; i++) 
  {
    Res[i] = Rands[i];
  }
  return(Res);
 }',

code = '
void foo()
{
  List x;
  x[0] = RandMat(3,3);
  Rf_PrintValue(wrap( x[0] )); // Prints first matrix in list.
}
')


foo()

如何在此处更改行Rf_PrintValue(wrap( x[0] ));以在第一行和第一列中打印元素?在我想用它的代码中,我需要提取这个元素来进行计算。

2 个答案:

答案 0 :(得分:8)

快速的:

  1. C ++中的复合表达有时会咬人;模板魔术挡路了。所以只需从List对象分配给任何元素,例如NumericMatrix

  2. 然后根据您的需要从NumericMatrix中选择。我们有row,col,element,... access。

  3. 使用Rcpp::Rcout << anElement可以更轻松地进行打印,但请注意,我们目前无法打印整个矩阵或向量 - 但intdouble类型正常。

  4. 编辑:

    以下是一个示例实现。

    #include <Rcpp.h>
    
    // [[Rcpp::export]]
    double sacha(Rcpp::List L) {
        double sum = 0;
        for (int i=0; i<L.size(); i++) {
            Rcpp::NumericMatrix M = L[i];
            double topleft = M(0,0);
            sum += topleft;
            Rcpp::Rcout << "Element is " << topleft << std::endl;
        }
        return sum;    
    }
    
    /*** R
    set.seed(42)
    L <- list(matrix(rnorm(9),3), matrix(1:9,3), matrix(sqrt(1:4),2))
    sacha(L) # fix typo   
    */
    

    结果:

    R> Rcpp::sourceCpp('/tmp/sacha.cpp')
    
    R> set.seed(42)
    
    R> L <- list(matrix(rnorm(9),3), matrix(1:9,3), matrix(sqrt(1:4),2))
    
    R> sacha(L)
    Element is 1.37096
    Element is 1
    Element is 1
    [1] 3.37096
    R>
    

答案 1 :(得分:6)

你必须在某些方面明确。 List类不知道它包含的元素类型,它不知道它是一个矩阵列表。

Dirk向您展示了我们通常所做的事情,将该元素作为NumericMatrix获取并处理矩阵。

这是一个替代方案,假设列表的所有元素都具有相同的结构,使用新的类模板:ListOf,并且有足够的粘合剂使用户代码无缝。这只是移动到一个不同的地方显而易见。

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp ;

template <typename WHAT>
class ListOf : public List {
public:
    template <typename T>
    ListOf( const T& x) : List(x){}

    WHAT operator[](int i){ return as<WHAT>( ( (List*)this)->operator[]( i) ) ; }

} ;

// [[Rcpp::export]]
double sacha( ListOf<NumericMatrix> x){
    double sum = 0.0 ; 
    for( int i=0; i<x.size(); i++){
        sum += x[i](0,0) ;    
    }
    return sum ;
}

/*** R
    L <- list(matrix(rnorm(9),3), matrix(1:9,3), matrix(sqrt(1:4),2))
    sacha( L )
*/

当我sourceCpp这个文件时,我得到:

> L <- list(matrix(rnorm(9), 3), matrix(1:9, 3), matrix(sqrt(1:4), 2))    
> sacha(L)
[1] 1.087057